Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
---|---|---|
Symbol | hsa-miR-222-5p | HLA-B |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0004569 | 3106 |
Organism | Homo sapiens | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | AS//B-4901//HLAB |
Resource | Symbol | SNP ID | SNP Position | Ref/Alt | |||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
miRNASNP-v3 | hsa-miR-222-5p |
|
Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RADAR | HLA-B |
|
Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID | |||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DARNED | HLA-B |
|
Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RMBase | HLA-B |
|
Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RNALocate | hsa-miR-222-5p |
|
|||||||||||
HLA-B |
Interactor1: hsa-miR-222-5p | Interactor2: HLA-B |
---|
Weak-Evidence | RNA-Seq//Small RNA sequencing | |
---|---|---|
Prediction-Evidence | DIANA//miRanda//PicTar//Targetscan | |
Support Database | ViRBase |
PMID | 31992777 | Target region | None |
---|---|---|---|
Source | ViRBase | Interactor1 expression | Downregulation |
Tissue or cell line | TEC cells | Interactor2 expression | None |
Description | The microRNA-target network (Fig. 4b,c) revealed 13 upregulated microRNAs that can modulate the expression of 12 downregulated target transcripts. |