Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | hsa-miR-27a-3p | ABCA1 |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0000084 | 19 |
Organism | Homo sapiens | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | ABC-1//ABC1//CERP//HDLCQTL13//HDLDT1//HPALP1//TGD |
Resource | Symbol | SNP ID | SNP Position | Ref/Alt | ||||||||||||||||||||||||
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miRNASNP-v3 | hsa-miR-27a-3p |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RADAR | ABCA1 |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID | |||||
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DARNED | ABCA1 |
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Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | ABCA1 |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RNALocate | hsa-miR-27a-3p |
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ABCA1 |
Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ncDR | hsa-miR-27a-3p |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | Link | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RNAInter | hsa-miR-27a-3p |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID | PMID |
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NoncoRNA | hsa-miR-27a-3p |
Interactor1: hsa-miR-27a-3p | Interactor2: ABCA1 |
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Strong-Evidence | Luciferase reporter assay//RT-PCR//Western blot | |
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Weak-Evidence | Microarray | |
Prediction-Evidence | Targetscan | |
Support Database | ViRBase |
PMID | 23449803 | Target region | 3'UTR |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | Upregulation |
Tissue or cell line | Huh7.5 cells | Interactor2 expression | None |
Description | Here we found that pre-miR-27a significantly repressed ABCA1 and, conversely, that anti-miR-27a increased the mRNA and protein levels of ABCA1 (Fig. 7A and B). We identified two miR-27a binding sites (sites 1 and 2) in the 3' UTR of ABCA1 (Fig. 7C) that were conserved between species (Fig. 7C). |