Basic Information:

  VIRBase ID:  

HHID00017868

  Virus:  

Zaire ebolavirus (ZEBOV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.5711

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-190a-3p:  MIMAT0026482          UBE2E1:  NM_001202476     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsa-miR-190a-3p	UBE2E1
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0026482	7324
Organism	Homo sapiens	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	UBCH6

ncRNA SNP information:

Resource	Symbol	SNP ID	SNP Position	Ref/Alt
miRNASNP-v3	hsa-miR-190a-3p	rs1367478528 chr15:62824008    C/T rs146591219 chr15:62824027    C/T rs1311298147 chr15:62824010    A/G rs771043955 chr15:62824015    T/C

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	UBE2E1	chr3:23879991(+) A-I      intronic chr3:23880066(+) A-I      intronic chr3:23880079(+) A-I      intronic chr3:23880174(+) A-I      intronic chr3:23880188(+) A-I      intronic chr3:23889050(+) A-I      intronic chr3:23889055(+) A-I      intronic chr3:23889060(+) A-I      intronic chr3:23889090(+) A-I      intronic chr3:23889229(+) A-I      intronic chr3:23889260(+) A-I      intronic chr3:23889713(+) A-I      intronic chr3:23889733(+) A-I      intronic chr3:23892265(+) A-I      intronic chr3:23917393(+) A-I      intronic chr3:23873484(+) A-I      intronic chr3:23915152(+) A-I      intronic chr3:23915116(+) A-I      intronic chr3:23911124(+) A-I      intronic chr3:23873985(+) A-I      intronic chr3:23910002(+) A-I      intronic chr3:23909949(+) A-I      intronic chr3:23909939(+) A-I      intronic chr3:23909917(+) A-I      intronic chr3:23900045(+) A-I      intronic chr3:23874009(+) A-I      intronic chr3:23874015(+) A-I      intronic chr3:23904268(+) A-I      intronic chr3:23873328(+) A-I      intronic chr3:23873477(+) A-I      intronic chr3:23904320(+) A-I      intronic chr3:23904343(+) A-I      intronic chr3:23904346(+) A-I      intronic chr3:23904366(+) A-I      intronic chr3:23907045(+) A-I      intronic chr3:23906900(+) A-I      intronic chr3:23906945(+) A-I      intronic chr3:23927375(+) A-I      intronic chr3:23927192(+) A-I      intronic chr3:23874029(+) A-I      intronic chr3:23906950(+) A-I      intronic chr3:23907035(+) A-I      intronic chr3:23927191(+) A-I      intronic chr3:23927187(+) A-I      intronic chr3:23927181(+) A-I      intronic chr3:23921997(+) A-I      intronic chr3:23921987(+) A-I      intronic chr3:23907066(+) A-I      intronic chr3:23915219(+) A-I      intronic chr3:23892268(+) A-I      intronic chr3:23892291(+) A-I      intronic chr3:23892294(+) A-I      intronic chr3:23892386(+) A-I      intronic chr3:23892429(+) A-I      intronic chr3:23892439(+) A-I      intronic chr3:23892457(+) A-I      intronic chr3:23897138(+) A-I      intronic chr3:23897157(+) A-I      intronic chr3:23897158(+) A-I      intronic chr3:23897166(+) A-I      intronic chr3:23897167(+) A-I      intronic chr3:23897174(+) A-I      intronic chr3:23897200(+) A-I      intronic chr3:23897206(+) A-I      intronic chr3:23897210(+) A-I      intronic chr3:23897214(+) A-I      intronic chr3:23897309(+) A-I      intronic chr3:23897582(+) A-I      intronic chr3:23897704(+) A-I      intronic chr3:23897741(+) A-I      intronic chr3:23897743(+) A-I      intronic chr3:23897780(+) A-I      intronic chr3:23897781(+) A-I      intronic chr3:23874021(+) A-I      intronic chr3:23899911(+) A-I      intronic chr3:23899950(+) A-I      intronic chr3:23874338(+) A-I      intronic chr3:23899952(+) A-I      intronic chr3:23874405(+) A-I      intronic chr3:23879658(+) A-I      intronic chr3:23900071(+) A-I      intronic chr3:23873239(+) A-I      intronic chr3:23873146(+) A-I      intronic chr3:23873135(+) A-I      intronic chr3:23864479(+) A-I      intronic chr3:23858780(+) A-I      intronic chr3:23858177(+) A-I      intronic chr3:23858143(+) A-I      intronic chr3:23858091(+) A-I      intronic chr3:23858083(+) A-I      intronic chr3:23858077(+) A-I      intronic chr3:23858071(+) A-I      intronic chr3:23858059(+) A-I      intronic chr3:23858051(+) A-I      intronic chr3:23858043(+) A-I      intronic chr3:23858038(+) A-I      intronic chr3:23858034(+) A-I      intronic chr3:23858020(+) A-I      intronic chr3:23858014(+) A-I      intronic chr3:23857978(+) A-I      intronic chr3:23856688(+) A-I      intronic chr3:23856589(+) A-I      intronic chr3:23855195(+) A-I      intronic chr3:23856608(+) A-I      intronic chr3:23856611(+) A-I      intronic chr3:23858792(+) A-I      intronic chr3:23858793(+) A-I      intronic chr3:23858825(+) A-I      intronic chr3:23907042(+) A-I      intronic chr3:23917357(+) A-I      intronic chr3:23889705(+) A-I      intronic chr3:23879578(+) A-I      intronic chr3:23889902(+) A-I      intronic chr3:23897647(+) A-I      intronic chr3:23889940(+) A-I      intronic chr3:23894472(+) A-I      intronic chr3:23906975(+) A-I      intronic chr3:23889882(+) A-I      intronic chr3:23897579(+) A-I      intronic chr3:23889889(+) A-I      intronic chr3:23931370(+) A-I      intronic chr3:23876145(+) A-I      intronic chr3:23892258(+) A-I      intronic chr3:23892087(+) A-I      intronic chr3:23917364(+) A-I      intronic chr3:23895626(+) A-I      intronic chr3:23894165(+) A-I      intronic chr3:23894198(+) A-I      intronic chr3:23879638(+) A-I      intronic chr3:23879768(+) A-I      intronic chr3:23904406(+) A-I      intronic chr3:23879662(+) A-I      intronic chr3:23864552(+) A-I      intronic chr3:23917363(+) A-I      intronic chr3:23897592(+) A-I      intronic chr3:23894186(+) A-I      intronic chr3:23874427(+) A-I      intronic chr3:23874450(+) A-I      intronic chr3:23879758(+) A-I      intronic chr3:23855593(+) A-I      intronic chr3:23879809(+) A-I      intronic chr3:23897779(+) A-I      intronic chr3:23874016(+) A-I      intronic chr3:23893069(+) A-I      intronic chr3:23874508(+) A-I      intronic chr3:23856604(+) A-I      intronic chr3:23875232(+) A-I      intronic chr3:23894083(+) A-I      intronic chr3:23897695(+) A-I      intronic chr3:23904316(+) A-I      intronic chr3:23894447(+) A-I      intronic chr3:23874106(+) A-I      intronic chr3:23899867(+) A-I      intronic chr3:23873127(+) A-I      intronic chr3:23889233(+) A-I      intronic chr3:23889246(+) A-I      intronic chr3:23874186(+) A-I      intronic chr3:23917447(+) A-I      intronic chr3:23873957(+) A-I      intronic chr3:23900000(+) A-I      intronic chr3:23858757(+) A-I      intronic chr3:23879628(+) A-I      intronic chr3:23889840(+) A-I      intronic chr3:23879772(+) A-I      intronic chr3:23888132(+) A-I      intronic chr3:23873305(+) A-I      intronic chr3:23921950(+) A-I      intronic chr3:23897066(+) A-I      intronic chr3:23873376(+) A-I      intronic chr3:23856613(+) A-I      intronic chr3:23900011(+) A-I      intronic chr3:23897799(+) A-I      intronic chr3:23917283(+) A-I      intronic chr3:23895681(+) A-I      intronic chr3:23857969(+) A-I      intronic chr3:23873101(+) A-I      intronic chr3:23889127(+) A-I      intronic chr3:23895615(+) A-I      intronic chr3:23887808(+) A-I      intronic chr3:23856747(+) A-I      intronic chr3:23895700(+) A-I      intronic chr3:23858205(+) A-I      intronic chr3:23858182(+) A-I      intronic chr3:23899963(+) A-I      intronic chr3:23897657(+) A-I      intronic chr3:23873471(+) A-I      intronic chr3:23893172(+) A-I      intronic chr3:23858019(+) A-I      intronic chr3:23897618(+) A-I      intronic chr3:23873872(+) A-I      intronic chr3:23858206(+) A-I      intronic chr3:23906976(+) A-I      intronic chr3:23874056(+) A-I      intronic chr3:23856682(+) A-I      intronic chr3:23894364(+) A-I      intronic chr3:23873149(+) A-I      intronic chr3:23873107(+) A-I      intronic chr3:23864612(+) A-I      intronic chr3:23873082(+) A-I      intronic chr3:23858766(+) A-I      intronic chr3:23889704(+) A-I      intronic chr3:23897762(+) A-I      intronic chr3:23864610(+) A-I      intronic chr3:23875342(+) A-I      intronic chr3:23900054(+) A-I      intronic chr3:23858104(+) A-I      intronic chr3:23897059(+) A-I      intronic chr3:23889691(+) A-I      intronic chr3:23892304(+) A-I      intronic chr3:23897782(+) A-I      intronic chr3:23873370(+) A-I      intronic chr3:23856502(+) A-I      intronic chr3:23864477(+) A-I      intronic chr3:23894160(+) A-I      intronic chr3:23897622(+) A-I      intronic chr3:23879671(+) A-I      intronic chr3:23855095(+) A-I      intronic chr3:23874541(+) A-I      intronic chr3:23876852(+) A-I      intronic chr3:23875306(+) A-I      intronic chr3:23879663(+) A-I      intronic chr3:23856601(+) A-I      intronic chr3:23889774(+) A-I      intronic chr3:23899872(+) A-I      intronic chr3:23873989(+) A-I      intronic chr3:23911125(+) A-I      intronic chr3:23889841(+) A-I      intronic chr3:23907028(+) A-I      intronic chr3:23889125(+) A-I      intronic chr3:23874284(+) A-I      intronic chr3:23889248(+) A-I      intronic chr3:23874102(+) A-I      intronic chr3:23856597(+) A-I      intronic chr3:23889773(+) A-I      intronic chr3:23897542(+) A-I      intronic chr3:23897082(+) A-I      intronic chr3:23864597(+) A-I      intronic chr3:23856504(+) A-I      intronic chr3:23873323(+) A-I      intronic chr3:23888001(+) A-I      intronic chr3:23874165(+) A-I      intronic chr3:23892071(+) A-I      intronic chr3:23889906(+) A-I      intronic chr3:23893150(+) A-I      intronic chr3:23900079(+) A-I      intronic chr3:23889911(+) A-I      intronic chr3:23897723(+) A-I      intronic chr3:23893146(+) A-I      intronic chr3:23879555(+) A-I      intronic chr3:23858181(+) A-I      intronic chr3:23889799(+) A-I      intronic chr3:23874288(+) A-I      intronic chr3:23894129(+) A-I      intronic chr3:23889726(+) A-I      intronic chr3:23873315(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	UBE2E1	chr3:23889840(+) A-I intron -    22327324 chr3:23856629(+) A-I intron -    21960545 chr3:23864819(+) A-I intron -    21960545 chr3:23875233(+) A-I intron -    21960545 chr3:23875330(+) A-I intron -    21960545 chr3:23889691(+) A-I intron -    21960545 chr3:23904560(+) A-C intron -    22484847 chr3:23855095(+) A-G intron -    22484847 chr3:23855179(+) A-G intron -    22484847 chr3:23856504(+) A-G intron -    22484847 chr3:23856597(+) A-G intron -    22484847 chr3:23856598(+) A-G intron -    22484847 chr3:23856601(+) A-G intron -    22484847 chr3:23856629(+) A-G intron -    22484847 chr3:23856682(+) A-G intron -    22484847 chr3:23857969(+) A-G intron -    22484847 chr3:23858104(+) A-G intron -    22484847 chr3:23858181(+) A-G intron -    22484847 chr3:23858182(+) A-G intron -    22484847 chr3:23858205(+) A-G intron -    22484847 chr3:23858206(+) A-G intron -    22484847 chr3:23864512(+) A-G intron -    22484847 chr3:23864552(+) A-G intron -    22484847 chr3:23864597(+) A-G intron -    22484847 chr3:23864612(+) A-G intron -    22484847 chr3:23871085(+) C-T intron -    22484847 chr3:23873082(+) A-G intron -    22484847 chr3:23873101(+) A-G intron -    22484847 chr3:23873202(+) C-T intron -    22484847 chr3:23873204(+) G-T intron -    22484847 chr3:23873281(+) A-G intron -    22484847 chr3:23873288(+) A-G intron -    22484847 chr3:23873376(+) A-G intron -    22484847 chr3:23873384(+) A-G intron -    22484847 chr3:23873957(+) A-G intron -    22484847 chr3:23873989(+) A-G intron -    22484847 chr3:23874016(+) A-G intron -    22484847 chr3:23874056(+) A-G intron -    22484847 chr3:23874057(+) A-G intron -    22484847 chr3:23874165(+) A-G intron -    22484847 chr3:23874270(+) T-C intron -    22484847 chr3:23874284(+) A-G intron -    22484847 chr3:23874445(+) A-G intron -    22484847 chr3:23874450(+) A-G intron -    22484847 chr3:23874508(+) A-G intron -    22484847 chr3:23875233(+) A-G intron -    22484847 chr3:23875298(+) A-G intron -    22484847 chr3:23875306(+) A-G intron -    22484847 chr3:23876145(+) A-G intron -    22484847 chr3:23876706(+) A-G intron -    22484847 chr3:23876725(+) T-C intron -    22484847 chr3:23876801(+) A-T intron -    22484847 chr3:23876805(+) A-T intron -    22484847 chr3:23879555(+) A-G intron -    22484847 chr3:23879578(+) A-G intron -    22484847 chr3:23879628(+) A-G intron -    22484847 chr3:23879638(+) A-G intron -    22484847 chr3:23879644(+) A-G intron -    22484847 chr3:23879659(+) A-G intron -    22484847 chr3:23879662(+) A-G intron -    22484847 chr3:23879663(+) A-G intron -    22484847 chr3:23879671(+) A-G intron -    22484847 chr3:23879758(+) A-G intron -    22484847 chr3:23879768(+) A-G intron -    22484847 chr3:23879809(+) A-G intron -    22484847 chr3:23879815(+) T-C intron -    22484847 chr3:23880793(+) A-G intron -    22484847 chr3:23880834(+) A-G intron -    22484847 chr3:23880860(+) T-C intron -    22484847 chr3:23880861(+) A-G intron -    22484847 chr3:23880870(+) A-G intron -    22484847 chr3:23887808(+) A-G intron -    22484847 chr3:23887826(+) A-G intron -    22484847 chr3:23888001(+) A-G intron -    22484847 chr3:23888112(+) A-G intron -    22484847 chr3:23888137(+) A-G intron -    22484847 chr3:23889125(+) A-G intron -    22484847 chr3:23889127(+) A-G intron -    22484847 chr3:23889168(+) A-G intron -    22484847 chr3:23889171(+) A-G intron -    22484847 chr3:23889193(+) A-G intron -    22484847 chr3:23889233(+) A-G intron -    22484847 chr3:23889248(+) A-G intron -    22484847 chr3:23889689(+) A-G intron -    22484847 chr3:23889691(+) A-G intron -    22484847 chr3:23889705(+) A-G intron -    22484847 chr3:23889750(+) A-G intron -    22484847 chr3:23889773(+) A-G intron -    22484847 chr3:23889774(+) A-G intron -    22484847 chr3:23889840(+) A-G intron -    22484847 chr3:23889841(+) A-G intron -    22484847 chr3:23889882(+) A-G intron -    22484847 chr3:23889911(+) A-G intron -    22484847 chr3:23892087(+) A-G intron -    22484847 chr3:23892193(+) G-T intron -    22484847 chr3:23892194(+) A-T intron -    22484847 chr3:23892258(+) A-G intron -    22484847 chr3:23892282(+) A-G intron -    22484847 chr3:23893069(+) A-G intron -    22484847 chr3:23894083(+) A-G intron -    22484847 chr3:23894105(+) A-G intron -    22484847 chr3:23894146(+) T-C intron -    22484847 chr3:23894160(+) A-G intron -    22484847 chr3:23894165(+) A-G intron -    22484847 chr3:23894186(+) A-G intron -    22484847 chr3:23894198(+) A-G intron -    22484847 chr3:23894407(+) T-G intron -    22484847 chr3:23894408(+) G-T intron -    22484847 chr3:23894412(+) T-G intron -    22484847 chr3:23894413(+) T-G intron -    22484847 chr3:23894420(+) G-T intron -    22484847 chr3:23894421(+) T-G intron -    22484847 chr3:23894628(+) C-T intron -    22484847 chr3:23895615(+) A-G intron -    22484847 chr3:23895626(+) A-G intron -    22484847 chr3:23897059(+) A-G intron -    22484847 chr3:23897066(+) A-G intron -    22484847 chr3:23897082(+) A-G intron -    22484847 chr3:23897102(+) C-T intron -    22484847 chr3:23897579(+) A-G intron -    22484847 chr3:23897592(+) A-G intron -    22484847 chr3:23897618(+) A-G intron -    22484847 chr3:23897622(+) A-G intron -    22484847 chr3:23897647(+) A-G intron -    22484847 chr3:23897648(+) A-G intron -    22484847 chr3:23897710(+) A-G intron -    22484847 chr3:23897723(+) A-G intron -    22484847 chr3:23897782(+) A-G intron -    22484847 chr3:23898511(+) G-A intron -    22484847 chr3:23899830(+) A-G intron -    22484847 chr3:23899872(+) A-G intron -    22484847 chr3:23899963(+) A-G intron -    22484847 chr3:23899985(+) A-G intron -    22484847 chr3:23900000(+) A-G intron -    22484847 chr3:23900011(+) A-G intron -    22484847 chr3:23900054(+) A-G intron -    22484847 chr3:23900079(+) A-G intron -    22484847 chr3:23904316(+) A-G intron -    22484847 chr3:23904329(+) A-G intron -    22484847 chr3:23904342(+) A-G intron -    22484847 chr3:23904356(+) A-G intron -    22484847 chr3:23904358(+) A-G intron -    22484847 chr3:23904406(+) A-G intron -    22484847 chr3:23905209(+) T-C intron -    22484847 chr3:23906975(+) A-G intron -    22484847 chr3:23915060(+) C-A intron -    22484847 chr3:23915126(+) A-G intron -    22484847 chr3:23917283(+) A-G intron -    22484847 chr3:23917447(+) A-G intron -    22484847 chr3:23918369(+) T-A intron -    22484847 chr3:23927421(+) C-A intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	UBE2E1	chr3:23847503-23847504(+) m6A 5'UTR//exon       24209618//24981863//27773536 chr3:23847567-23847568(+) m6A 5'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//27773536 chr3:23848592-23848593(+) m6A 5'UTR//intron       24284625//24209618//24981863//27773536 chr3:23848823-23848824(+) m6A CDS//exon       24981863//26404942//27773535 chr3:23848835-23848836(+) m6A CDS//exon       24981863//26404942//27773535 chr3:23848881-23848882(+) m6A CDS//exon       24981863//26404942//27773535 chr3:23848888-23848889(+) m6A CDS//exon       24981863//26404942//27773535 chr3:23848954-23848955(+) m6A exon//intron       24981863//26404942 chr3:23851963-23851964(+) m6A 5'UTR//intron       25456834//24981863 chr3:23851983-23851984(+) m6A CDS//intron       25456834//24981863 chr3:23930663-23930664(+) m6A CDS//exon       26404942 chr3:23930714-23930715(+) Y CDS//exon       26075521 chr3:23932051-23932052(+) m6A CDS//exon       26404942 chr3:23932069-23932070(+) m6A CDS//exon       26404942 chr3:23932076-23932077(+) m6A CDS//exon       26404942 chr3:23932357-23932358(+) m6A 3'UTR//exon       27773535 chr3:23932395-23932396(+) m6A 3'UTR//exon       27773535 chr3:23932451-23932452(+) m6A 3'UTR//exon       27773535 chr3:23932472-23932473(+) m6A 3'UTR//exon       27773535 chr3:23932508-23932509(+) m6A 3'UTR//exon       26404942//27773535 chr3:23932562-23932563(+) m6A 3'UTR//exon       26404942//27773535 chr3:23932577-23932578(+) m6A 3'UTR//exon       26404942//27773535 chr3:23932652-23932653(+) m6A 3'UTR       26404942//27773535 chr3:23932662-23932663(+) m6A 3'UTR       27773535 chr3:23932745-23932746(+) m6A 3'UTR       27773535

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	hsa-miR-190a-3p	Exosome Plasma     23663360 Exosome Plasma     24683445 Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     - Microvesicle Cell lines(GBM46|GBM8|HaCaT|K562|MCF-10A|MCF-7|MGG75)|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocytes     -
	UBE2E1	Chromatin K562 cells     - Cytosol HCC cell line (HepG2)     - Exosome Blood     - Membrane K562 cells     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsa-miR-190a-3p
Interactor2: UBE2E1

Evidence Support:

Weak-Evidence	RNA-Seq
Prediction-Evidence	Targetscan
Support Database	ViRBase

References:

PMID	31570108	Target region	None
Source	ViRBase	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	ARPE-19 human RPE cells	Interactor2 expression	None
Description	Table 1 List of miRNAs that were differentially expressed between EBOV- and mock-infected human RPE cells at 24 h post-infection.Putative target genes in EBOV-infected human RPE cells were predicted from the 15 highly differentially expressed miRNAs using algorithms: 2629 targets by Diana microT; 1799 targets by miRDB; and 14315 targets by TargetScan (Additional file 5).