Basic Information:

  VIRBase ID:  

HHID00014174

  Virus:  

Zaire ebolavirus (ZEBOV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.5908

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-365a-5p:  MIMAT0009199          IGBP1:  NM_001370194     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsa-miR-365a-5p	IGBP1
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0009199	3476
Organism	Homo sapiens	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	ALPHA-4//alpha4//IBP1

ncRNA SNP information:

Resource	Symbol	SNP ID	SNP Position	Ref/Alt
miRNASNP-v3	hsa-miR-365a-5p	rs1166908611 chr16:14309308    T/C rs1368596991 chr16:14309314    G/A rs1380926089 chr16:14309318    A/G rs1396179427 chr16:14309310    G/C rs1428928383 chr16:14309320    G/A rs773834113 chr16:14309301    G/C

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	IGBP1	chrX:69375158(+) A-I      intronic chrX:69371306(+) A-I      intronic chrX:69371261(+) A-I      intronic chrX:69371260(+) A-I      intronic chrX:69363791(+) A-I      intronic chrX:69363122(+) A-I      intronic chrX:69363106(+) A-I      intronic chrX:69361103(+) A-I      intronic chrX:69361036(+) A-I      intronic chrX:69358130(+) A-I      intronic chrX:69375083(+) A-I      intronic chrX:69375097(+) A-I      intronic chrX:69375113(+) A-I      intronic chrX:69358974(+) A-I      intronic chrX:69359017(+) A-I      intronic chrX:69359085(+) A-I      intronic chrX:69359088(+) A-I      intronic chrX:69359101(+) A-I      intronic chrX:69360932(+) A-I      intronic chrX:69360940(+) A-I      intronic chrX:69361086(+) A-I      intronic chrX:69361139(+) A-I      intronic chrX:69361146(+) A-I      intronic chrX:69362101(+) A-I      intronic chrX:69362395(+) A-I      intronic chrX:69362601(+) A-I      intronic chrX:69357787(+) A-I      intronic chrX:69361070(+) A-I      intronic chrX:69356722(+) A-I      intronic chrX:69362792(+) A-I      intronic chrX:69370966(+) A-I      intronic chrX:69370976(+) A-I      intronic chrX:69362796(+) A-I      intronic chrX:69362914(+) A-I      intronic chrX:69362922(+) A-I      intronic chrX:69363048(+) A-I      intronic chrX:69363818(+) A-I      intronic chrX:69363836(+) A-I      intronic chrX:69363837(+) A-I      intronic chrX:69363876(+) A-I      intronic chrX:69363878(+) A-I      intronic chrX:69363880(+) A-I      intronic chrX:69363915(+) A-I      intronic chrX:69363953(+) A-I      intronic chrX:69363963(+) A-I      intronic chrX:69358129(+) A-I      intronic chrX:69359105(+) A-I      intronic chrX:69371215(+) A-I      intronic chrX:69375143(+) A-I      intronic chrX:69364542(+) A-I      intronic chrX:69364561(+) A-I      intronic chrX:69364020(+) A-I      intronic chrX:69364571(+) A-I      intronic chrX:69383147(+) A-I      intronic chrX:69371236(+) A-I      intronic chrX:69371499(+) A-I      intronic chrX:69371662(+) A-I      intronic chrX:69371678(+) A-I      intronic chrX:69374104(+) A-I      intronic chrX:69374479(+) A-I      intronic chrX:69374480(+) A-I      intronic chrX:69382659(+) A-I      intronic chrX:69382623(+) A-I      intronic chrX:69374600(+) A-I      intronic chrX:69382568(+) A-I      intronic chrX:69359112(+) A-I      intronic chrX:69357782(+) A-I      intronic chrX:69364744(+) A-I      intronic chrX:69364739(+) A-I      intronic chrX:69364651(+) A-I      intronic chrX:69364649(+) A-I      intronic chrX:69358964(+) A-I      intronic chrX:69358961(+) A-I      intronic chrX:69358953(+) A-I      intronic chrX:69358940(+) A-I      intronic chrX:69358149(+) A-I      intronic chrX:69382574(+) A-I      intronic chrX:69376745(+) A-I      intronic chrX:69378626(+) A-I      intronic chrX:69375174(+) A-I      intronic chrX:69364610(+) A-I      intronic chrX:69375169(+) A-I      intronic chrX:69362036(+) A-I      intronic chrX:69362626(+) A-I      intronic chrX:69383098(+) A-I      intronic chrX:69363034(+) A-I      intronic chrX:69374605(+) A-I      intronic chrX:69363813(+) A-I      intronic chrX:69374735(+) A-I      intronic chrX:69371246(+) A-I      intronic chrX:69361066(+) A-I      intronic chrX:69374034(+) A-I      intronic chrX:69357728(+) A-I      intronic chrX:69362519(+) A-I      intronic chrX:69378628(+) A-I      intronic chrX:69383144(+) A-I      intronic chrX:69362060(+) A-I      intronic chrX:69356640(+) A-I      intronic chrX:69364627(+) A-I      intronic chrX:69383161(+) A-I      intronic chrX:69382622(+) A-I      intronic chrX:69371278(+) A-I      intronic chrX:69363927(+) A-I      intronic chrX:69361950(+) A-I      intronic chrX:69363118(+) A-I      intronic chrX:69370867(+) A-I      intronic chrX:69371472(+) A-I      intronic chrX:69358145(+) A-I      intronic chrX:69356696(+) A-I      intronic chrX:69363146(+) A-I      intronic chrX:69374107(+) A-I      intronic chrX:69371607(+) A-I      intronic chrX:69363828(+) A-I      intronic chrX:69362817(+) A-I      intronic chrX:69362912(+) A-I      intronic chrX:69383143(+) A-I      intronic chrX:69371591(+) A-I      intronic chrX:69362482(+) A-I      intronic chrX:69360971(+) A-I      intronic chrX:69375189(+) A-I      intronic chrX:69362136(+) A-I      intronic chrX:69383171(+) A-I      intronic chrX:69378546(+) A-I      intronic chrX:69359040(+) A-I      intronic chrX:69362146(+) A-I      intronic chrX:69382958(+) A-I      intronic chrX:69382703(+) A-I      intronic chrX:69363879(+) A-I      intronic chrX:69364707(+) A-I      intronic chrX:69371456(+) A-I      intronic chrX:69359039(+) A-I      intronic chrX:69383170(+) A-I      intronic chrX:69371466(+) A-I      intronic chrX:69363990(+) A-I      intronic chrX:69374056(+) A-I      intronic chrX:69362466(+) A-I      intronic chrX:69382604(+) A-I      intronic chrX:69362902(+) A-I      intronic chrX:69357865(+) A-I      intronic chrX:69363989(+) A-I      intronic chrX:69362548(+) A-I      intronic chrX:69357754(+) A-I      intronic chrX:69362522(+) A-I      intronic chrX:69356737(+) A-I      intronic chrX:69362518(+) A-I      intronic chrX:69375159(+) A-I      intronic chrX:69363158(+) A-I      intronic chrX:69371572(+) A-I      intronic chrX:69374474(+) A-I      intronic chrX:69375144(+) A-I      intronic chrX:69362397(+) A-I      intronic chrX:69357705(+) A-I      intronic chrX:69357797(+) A-I      intronic chrX:69358190(+) A-I      intronic chrX:69358216(+) A-I      intronic chrX:69357734(+) A-I      intronic chrX:69362979(+) A-I      intronic chrX:69362929(+) A-I      intronic chrX:69374046(+) A-I      intronic chrX:69374550(+) A-I      intronic chrX:69358945(+) A-I      intronic chrX:69357866(+) A-I      intronic chrX:69356702(+) A-I      intronic chrX:69363123(+) A-I      intronic chrX:69371288(+) A-I      intronic chrX:69370991(+) A-I      intronic chrX:69367162(+) A-I      intronic chrX:69363046(+) A-I      intronic chrX:69362440(+) A-I      intronic chrX:69360934(+) A-I      intronic chrX:69356791(+) A-I      intronic chrX:69362854(+) A-I      intronic chrX:69362621(+) A-I      intronic chrX:69364023(+) A-I      intronic chrX:69374527(+) A-I      intronic chrX:69371601(+) A-I      intronic chrX:69356766(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	IGBP1	chrX:69356737(+) A-G intron -    22484847 chrX:69356766(+) A-G intron -    22484847 chrX:69357773(+) A-G intron -    22484847 chrX:69357781(+) A-G intron -    22484847 chrX:69361905(+) A-G intron -    22484847 chrX:69362136(+) A-G intron -    22484847 chrX:69362413(+) A-G intron -    22484847 chrX:69362466(+) A-G intron -    22484847 chrX:69362548(+) A-G intron -    22484847 chrX:69362971(+) A-G intron -    22484847 chrX:69362979(+) A-G intron -    22484847 chrX:69363873(+) A-G intron -    22484847 chrX:69363990(+) A-G intron -    22484847 chrX:69364023(+) A-G intron -    22484847 chrX:69364025(+) A-G intron -    22484847 chrX:69371591(+) A-G intron -    22484847 chrX:69371683(+) A-G intron -    22484847 chrX:69383161(+) A-G intron -    22484847 chrX:69383170(+) A-G intron -    22484847 chrX:69383171(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	IGBP1	chrX:69353327-69353328(+) m6A 5'UTR       24981863 chrX:69353361-69353362(+) m6A 5'UTR       24981863 chrX:69353406-69353407(+) m6A 5'UTR//intron       24981863 chrX:69354456-69354457(+) m6A CDS       24284625//24981863//27773535//22608085 chrX:69354504-69354505(+) m6A CDS       24284625//24981863//27773535//22608085 chrX:69354515-69354516(+) m6A CDS       24284625//24981863//26404942//27773535//22608085 chrX:69354568-69354569(+) m6A CDS       24284625//24981863//26404942//27773535//22608085 chrX:69354575-69354576(+) m6A CDS       24284625//24981863//26404942//27773535//22608085 chrX:69354648-69354649(+) m6A CDS       24284625//24981863//22608085 chrX:69385716-69385717(+) m6A CDS       25456834//24981863//27773535//27371828//22608085 chrX:69385746-69385747(+) m6A CDS       25456834//24981863//27773535//27371828//22608085 chrX:69385787-69385788(+) m6A CDS       25456834//24981863//27773535//27371828//22608085 chrX:69385811-69385812(+) m6A CDS       25456834//24981863//26404942//27773535//27371828//22608085 chrX:69385820-69385821(+) m6A CDS       25456834//24981863//26404942//27773535//22608085 chrX:69385851-69385852(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863//22608085 chrX:69385884-69385885(+) m6A 3'UTR       25456834 chrX:69386014-69386015(+) m6A 3'UTR       27773535

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	hsa-miR-365a-5p	Exosome Plasma     23663360 Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     - Microvesicle Seminal plasma     23539611 Microvesicle Fibroblasts|Mesenchymal stem cells     - Mitochondrion Skeletal muscle myoblasts     21637849 Mitochondrion Cell line (HEK-293|HeLa)     22984580
	IGBP1	Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Exosome Blood     - Nucleoplasm K562 cells     - Ribosome HEK-293 cells     22199352 Ribosome-free cytosol Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsa-miR-365a-5p
Interactor2: IGBP1

Evidence Support:

Weak-Evidence	RNA-Seq
Prediction-Evidence	DIANA-microT//Targetscan
Support Database	ViRBase

References:

PMID	31570108	Target region	None
Source	ViRBase	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	ARPE-19 human RPE cells	Interactor2 expression	None
Description	Table 1 List of miRNAs that were differentially expressed between EBOV- and mock-infected human RPE cells at 24 h post-infection.Putative target genes in EBOV-infected human RPE cells were predicted from the 15 highly differentially expressed miRNAs using algorithms: 2629 targets by Diana microT; 1799 targets by miRDB; and 14315 targets by TargetScan (Additional file 5).