Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

HHID00008799

  Virus:  

Zaire ebolavirus (ZEBOV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.5908

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-100-3p:           VKORC1L1:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hsa-miR-100-3p VKORC1L1
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0004512 154807
Organism Homo sapiens Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - -

ncRNA SNP information:


Resource Symbol SNP ID SNP Position Ref/Alt
miRNASNP-v3 hsa-miR-100-3p
rs1388368183 chr11:122152253    A/G
rs530428149 chr11:122152245    C/T
rs749039221 chr11:122152247    A/G
rs775253529 chr11:122152245    CTA/C
rs909526986 chr11:122152248    T/C
rs1321972926 chr11:122152258    C/T
rs770590792 chr11:122152255    A/G
rs773933142 chr11:122152260    T/C
rs773933142 chr11:122152260    T/G

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR VKORC1L1
chr7:65348215(+) A-I      intronic
chr7:65343807(+) A-I      intronic
chr7:65411944(+) A-I      intronic
chr7:65343789(+) A-I      intronic
chr7:65411943(+) A-I      intronic
chr7:65411942(+) A-I      intronic
chr7:65411920(+) A-I      intronic
chr7:65343746(+) A-I      intronic
chr7:65411912(+) A-I      intronic
chr7:65343688(+) A-I      intronic
chr7:65343636(+) A-I      intronic
chr7:65343384(+) A-I      intronic
chr7:65343349(+) A-I      intronic
chr7:65343323(+) A-I      intronic
chr7:65343314(+) A-I      intronic
chr7:65343218(+) A-I      intronic
chr7:65342615(+) A-I      intronic
chr7:65342557(+) A-I      intronic
chr7:65342544(+) A-I      intronic
chr7:65342500(+) A-I      intronic
chr7:65342487(+) A-I      intronic
chr7:65342476(+) A-I      intronic
chr7:65342461(+) A-I      intronic
chr7:65342460(+) A-I      intronic
chr7:65342452(+) A-I      intronic
chr7:65342434(+) A-I      intronic
chr7:65342421(+) A-I      intronic
chr7:65348154(+) A-I      intronic
chr7:65347130(+) A-I      intronic
chr7:65347111(+) A-I      intronic
chr7:65347095(+) A-I      intronic
chr7:65346956(+) A-I      intronic
chr7:65346789(+) A-I      intronic
chr7:65345115(+) A-I      intronic
chr7:65345110(+) A-I      intronic
chr7:65345102(+) A-I      intronic
chr7:65345039(+) A-I      intronic
chr7:65344956(+) A-I      intronic
chr7:65351698(+) A-I      intronic
chr7:65351700(+) A-I      intronic
chr7:65352110(+) A-I      intronic
chr7:65355062(+) A-I      intronic
chr7:65342415(+) A-I      intronic
chr7:65341441(+) A-I      intronic
chr7:65341404(+) A-I      intronic
chr7:65341378(+) A-I      intronic
chr7:65341314(+) A-I      intronic
chr7:65340603(+) A-I      intronic
chr7:65355070(+) A-I      intronic
chr7:65358304(+) A-I      intronic
chr7:65358368(+) A-I      intronic
chr7:65358997(+) A-I      intronic
chr7:65359021(+) A-I      intronic
chr7:65359035(+) A-I      intronic
chr7:65359041(+) A-I      intronic
chr7:65359094(+) A-I      intronic
chr7:65359142(+) A-I      intronic
chr7:65359482(+) A-I      intronic
chr7:65359487(+) A-I      intronic
chr7:65359576(+) A-I      intronic
chr7:65359594(+) A-I      intronic
chr7:65359600(+) A-I      intronic
chr7:65359604(+) A-I      intronic
chr7:65340426(+) A-I      intronic
chr7:65339682(+) A-I      intronic
chr7:65339672(+) A-I      intronic
chr7:65339670(+) A-I      intronic
chr7:65339662(+) A-I      intronic
chr7:65339642(+) A-I      intronic
chr7:65359672(+) A-I      intronic
chr7:65361000(+) A-I      intronic
chr7:65361009(+) A-I      intronic
chr7:65361073(+) A-I      intronic
chr7:65361152(+) A-I      intronic
chr7:65361724(+) A-I      intronic
chr7:65359042(+) A-I      intronic
chr7:65361733(+) A-I      intronic
chr7:65361914(+) A-I      intronic
chr7:65339633(+) A-I      intronic
chr7:65339540(+) A-I      intronic
chr7:65339460(+) A-I      intronic
chr7:65339432(+) A-I      intronic
chr7:65339394(+) A-I      intronic
chr7:65363213(+) A-I      intronic
chr7:65363215(+) A-I      intronic
chr7:65363240(+) A-I      intronic
chr7:65363274(+) A-I      intronic
chr7:65363282(+) A-I      intronic
chr7:65363314(+) A-I      intronic
chr7:65363318(+) A-I      intronic
chr7:65364723(+) A-I      intronic
chr7:65364829(+) A-I      intronic
chr7:65364831(+) A-I      intronic
chr7:65364844(+) A-I      intronic
chr7:65364867(+) A-I      intronic
chr7:65364912(+) A-I      intronic
chr7:65364936(+) A-I      intronic
chr7:65364952(+) A-I      intronic
chr7:65365199(+) A-I      intronic
chr7:65365230(+) A-I      intronic
chr7:65365266(+) A-I      intronic
chr7:65365580(+) A-I      intronic
chr7:65365603(+) A-I      intronic
chr7:65365604(+) A-I      intronic
chr7:65367928(+) A-I      intronic
chr7:65349530(+) A-I      intronic
chr7:65349526(+) A-I      intronic
chr7:65349509(+) A-I      intronic
chr7:65349447(+) A-I      intronic
chr7:65349395(+) A-I      intronic
chr7:65349369(+) A-I      intronic
chr7:65349368(+) A-I      intronic
chr7:65349357(+) A-I      intronic
chr7:65348670(+) A-I      intronic
chr7:65367995(+) A-I      intronic
chr7:65351544(+) A-I      intronic
chr7:65368068(+) A-I      intronic
chr7:65368127(+) A-I      intronic
chr7:65368234(+) A-I      intronic
chr7:65368253(+) A-I      intronic
chr7:65368337(+) A-I      intronic
chr7:65368432(+) A-I      intronic
chr7:65368435(+) A-I      intronic
chr7:65368512(+) A-I      intronic
chr7:65368520(+) A-I      intronic
chr7:65368597(+) A-I      intronic
chr7:65368612(+) A-I      intronic
chr7:65369221(+) A-I      intronic
chr7:65369227(+) A-I      intronic
chr7:65369333(+) A-I      intronic
chr7:65370341(+) A-I      intronic
chr7:65370436(+) A-I      intronic
chr7:65370454(+) A-I      intronic
chr7:65370463(+) A-I      intronic
chr7:65370472(+) A-I      intronic
chr7:65370478(+) A-I      intronic
chr7:65370487(+) A-I      intronic
chr7:65370495(+) A-I      intronic
chr7:65370503(+) A-I      intronic
chr7:65370518(+) A-I      intronic
chr7:65370539(+) A-I      intronic
chr7:65372171(+) A-I      intronic
chr7:65372172(+) A-I      intronic
chr7:65372241(+) A-I      intronic
chr7:65372252(+) A-I      intronic
chr7:65372301(+) A-I      intronic
chr7:65372304(+) A-I      intronic
chr7:65372309(+) A-I      intronic
chr7:65372318(+) A-I      intronic
chr7:65372370(+) A-I      intronic
chr7:65372375(+) A-I      intronic
chr7:65373145(+) A-I      intronic
chr7:65373717(+) A-I      intronic
chr7:65374112(+) A-I      intronic
chr7:65351664(+) A-I      intronic
chr7:65374805(+) A-I      intronic
chr7:65374914(+) A-I      intronic
chr7:65376629(+) A-I      intronic
chr7:65378484(+) A-I      intronic
chr7:65378527(+) A-I      intronic
chr7:65378553(+) A-I      intronic
chr7:65378619(+) A-I      intronic
chr7:65379155(+) A-I      intronic
chr7:65379280(+) A-I      intronic
chr7:65379748(+) A-I      intronic
chr7:65379761(+) A-I      intronic
chr7:65379805(+) A-I      intronic
chr7:65379813(+) A-I      intronic
chr7:65379829(+) A-I      intronic
chr7:65379845(+) A-I      intronic
chr7:65379975(+) A-I      intronic
chr7:65380110(+) A-I      intronic
chr7:65380159(+) A-I      intronic
chr7:65380849(+) A-I      intronic
chr7:65381047(+) A-I      intronic
chr7:65384807(+) A-I      intronic
chr7:65386485(+) A-I      intronic
chr7:65386499(+) A-I      intronic
chr7:65386528(+) A-I      intronic
chr7:65388207(+) A-I      intronic
chr7:65388278(+) A-I      intronic
chr7:65391272(+) A-I      intronic
chr7:65391326(+) A-I      intronic
chr7:65342447(+) A-I      intronic
chr7:65391402(+) A-I      intronic
chr7:65392067(+) A-I      intronic
chr7:65392088(+) A-I      intronic
chr7:65397146(+) A-I      intronic
chr7:65397154(+) A-I      intronic
chr7:65397282(+) A-I      intronic
chr7:65397314(+) A-I      intronic
chr7:65397320(+) A-I      intronic
chr7:65397817(+) A-I      intronic
chr7:65397820(+) A-I      intronic
chr7:65397863(+) A-I      intronic
chr7:65399128(+) A-I      intronic
chr7:65399894(+) A-I      intronic
chr7:65399921(+) A-I      intronic
chr7:65399934(+) A-I      intronic
chr7:65400396(+) A-I      intronic
chr7:65400432(+) A-I      intronic
chr7:65400480(+) A-I      intronic
chr7:65400548(+) A-I      intronic
chr7:65402437(+) A-I      intronic
chr7:65402443(+) A-I      intronic
chr7:65402589(+) A-I      intronic
chr7:65402600(+) A-I      intronic
chr7:65418019(+) A-I      intronic
chr7:65402967(+) A-I      intronic
chr7:65418004(+) A-I      intronic
chr7:65403009(+) A-I      intronic
chr7:65411950(+) A-I      intronic
chr7:65403101(+) A-I      intronic
chr7:65405173(+) A-I      intronic
chr7:65405212(+) A-I      intronic
chr7:65406303(+) A-I      intronic
chr7:65407428(+) A-I      intronic
chr7:65407434(+) A-I      intronic
chr7:65407589(+) A-I      intronic
chr7:65408655(+) A-I      intronic
chr7:65408662(+) A-I      intronic
chr7:65408683(+) A-I      intronic
chr7:65408684(+) A-I      intronic
chr7:65409984(+) A-I      intronic
chr7:65410134(+) A-I      intronic
chr7:65410137(+) A-I      intronic
chr7:65410169(+) A-I      intronic
chr7:65412040(+) A-I      intronic
chr7:65416313(+) A-I      intronic
chr7:65412770(+) A-I      intronic
chr7:65412875(+) A-I      intronic
chr7:65416291(+) A-I      intronic
chr7:65416359(+) A-I      intronic
chr7:65416360(+) A-I      intronic
chr7:65416365(+) A-I      intronic
chr7:65416390(+) A-I      intronic
chr7:65417873(+) A-I      intronic
chr7:65417902(+) A-I      intronic
chr7:65351690(+) A-I      intronic
chr7:65417981(+) A-I      intronic
chr7:65417984(+) A-I      intronic
chr7:65418036(+) A-I      intronic
chr7:65418052(+) A-I      intronic
chr7:65418785(+) A-I      intronic
chr7:65348616(+) A-I      intronic
chr7:65348587(+) A-I      intronic
chr7:65348373(+) A-I      intronic
chr7:65348246(+) A-I      intronic
chr7:65348228(+) A-I      intronic
chr7:65422699(+) A-I      3'UTR
chr7:65422698(+) A-I      3'UTR
chr7:65422600(+) A-I      3'UTR
chr7:65422658(+) A-I      3'UTR
chr7:65422664(+) A-I      3'UTR
chr7:65422744(+) A-I      3'UTR
chr7:65422739(+) A-I      3'UTR
chr7:65422668(+) A-I      3'UTR
chr7:65421474(+) A-I      3'UTR
chr7:65422692(+) A-I      3'UTR
chr7:65422673(+) A-I      3'UTR
chr7:65422670(+) A-I      3'UTR
chr7:65422681(+) A-I      3'UTR
chr7:65422660(+) A-I      3'UTR
chr7:65422704(+) A-I      3'UTR
chr7:65422713(+) A-I      3'UTR
chr7:65422764(+) A-I      3'UTR
chr7:65422558(+) A-I      3'UTR
chr7:65365614(+) A-I      intronic
chr7:65359059(+) A-I      intronic
chr7:65380208(+) A-I      intronic
chr7:65397889(+) A-I      intronic
chr7:65368280(+) A-I      intronic
chr7:65369358(+) A-I      intronic
chr7:65343845(+) A-I      intronic
chr7:65358309(+) A-I      intronic
chr7:65361159(+) A-I      intronic
chr7:65397149(+) A-I      intronic
chr7:65368115(+) A-I      intronic
chr7:65409319(+) A-I      intronic
chr7:65391204(+) A-I      intronic
chr7:65374154(+) A-I      intronic
chr7:65363271(+) A-I      intronic
chr7:65361849(+) A-I      intronic
chr7:65402514(+) A-I      intronic
chr7:65380285(+) A-I      intronic
chr7:65363239(+) A-I      intronic
chr7:65341304(+) A-I      intronic
chr7:65380832(+) A-I      intronic
chr7:65406741(+) A-I      intronic
chr7:65343750(+) A-I      intronic
chr7:65358469(+) A-I      intronic
chr7:65374002(+) A-I      intronic
chr7:65342464(+) A-I      intronic
chr7:65368679(+) A-I      intronic
chr7:65348667(+) A-I      intronic
chr7:65359107(+) A-I      intronic
chr7:65380277(+) A-I      intronic
chr7:65344902(+) A-I      intronic
chr7:65386396(+) A-I      intronic
chr7:65374103(+) A-I      intronic
chr7:65383906(+) A-I      intronic
chr7:65399817(+) A-I      intronic
chr7:65374218(+) A-I      intronic
chr7:65361833(+) A-I      intronic
chr7:65379746(+) A-I      intronic
chr7:65408767(+) A-I      intronic
chr7:65352043(+) A-I      intronic
chr7:65379193(+) A-I      intronic
chr7:65397210(+) A-I      intronic
chr7:65355325(+) A-I      intronic
chr7:65406292(+) A-I      intronic
chr7:65418667(+) A-I      intronic
chr7:65369270(+) A-I      intronic
chr7:65343378(+) A-I      intronic
chr7:65361893(+) A-I      intronic
chr7:65406117(+) A-I      intronic
chr7:65399853(+) A-I      intronic
chr7:65399770(+) A-I      intronic
chr7:65348268(+) A-I      intronic
chr7:65373609(+) A-I      intronic
chr7:65341368(+) A-I      intronic
chr7:65349459(+) A-I      intronic
chr7:65363254(+) A-I      intronic
chr7:65397189(+) A-I      intronic
chr7:65342439(+) A-I      intronic
chr7:65399809(+) A-I      intronic
chr7:65399830(+) A-I      intronic
chr7:65399825(+) A-I      intronic
chr7:65368598(+) A-I      intronic
chr7:65345062(+) A-I      intronic
chr7:65399854(+) A-I      intronic
chr7:65367918(+) A-I      intronic
chr7:65370367(+) A-I      intronic
chr7:65360356(+) A-I      intronic
chr7:65399808(+) A-I      intronic
chr7:65417915(+) A-I      intronic
chr7:65412110(+) A-I      intronic
chr7:65367983(+) A-I      intronic
chr7:65371188(+) A-I      intronic
chr7:65418817(+) A-I      intronic
chr7:65378453(+) A-I      intronic
chr7:65371318(+) A-I      intronic
chr7:65380220(+) A-I      intronic
chr7:65379272(+) A-I      intronic
chr7:65343379(+) A-I      intronic
chr7:65377087(+) A-I      intronic
chr7:65363180(+) A-I      intronic
chr7:65369254(+) A-I      intronic
chr7:65361759(+) A-I      intronic
chr7:65349462(+) A-I      intronic
chr7:65403075(+) A-I      intronic
chr7:65373637(+) A-I      intronic
chr7:65342520(+) A-I      intronic
chr7:65400426(+) A-I      intronic
chr7:65380245(+) A-I      intronic
chr7:65418772(+) A-I      intronic
chr7:65394779(+) A-I      intronic
chr7:65414608(+) A-I      intronic
chr7:65340611(+) A-I      intronic
chr7:65406232(+) A-I      intronic
chr7:65402493(+) A-I      intronic
chr7:65343728(+) A-I      intronic
chr7:65379279(+) A-I      intronic
chr7:65361730(+) A-I      intronic
chr7:65380244(+) A-I      intronic
chr7:65371207(+) A-I      intronic
chr7:65392263(+) A-I      intronic
chr7:65379731(+) A-I      intronic
chr7:65360983(+) A-I      intronic
chr7:65369219(+) A-I      intronic
chr7:65386390(+) A-I      intronic
chr7:65364942(+) A-I      intronic
chr7:65339424(+) A-I      intronic
chr7:65424020(+) A-I      3'UTR
chr7:65422212(+) A-I      3'UTR
chr7:65422638(+) A-I      3'UTR
chr7:65422266(+) A-I      3'UTR
chr7:65424213(+) A-I      3'UTR
chr7:65422210(+) A-I      3'UTR
chr7:65422258(+) A-I      3'UTR
chr7:65344918(+) A-I      intronic
chr7:65348668(+) A-I      intronic
chr7:65342404(+) A-I      intronic
chr7:65361779(+) A-I      intronic
chr7:65369389(+) A-I      intronic
chr7:65379136(+) A-I      intronic
chr7:65407713(+) A-I      intronic
chr7:65372214(+) A-I      intronic
chr7:65371281(+) A-I      intronic
chr7:65359537(+) A-I      intronic
chr7:65344870(+) A-I      intronic
chr7:65405221(+) A-I      intronic
chr7:65359081(+) A-I      intronic
chr7:65344943(+) A-I      intronic
chr7:65367890(+) A-I      intronic
chr7:65363179(+) A-I      intronic
chr7:65402481(+) A-I      intronic
chr7:65412915(+) A-I      intronic
chr7:65407568(+) A-I      intronic
chr7:65361906(+) A-I      intronic
chr7:65384898(+) A-I      intronic
chr7:65412807(+) A-I      intronic
chr7:65388242(+) A-I      intronic
chr7:65379981(+) A-I      intronic
chr7:65344951(+) A-I      intronic
chr7:65407642(+) A-I      intronic
chr7:65379181(+) A-I      intronic
chr7:65417967(+) A-I      intronic
chr7:65367953(+) A-I      intronic
chr7:65379732(+) A-I      intronic
chr7:65360421(+) A-I      intronic
chr7:65368609(+) A-I      intronic
chr7:65348580(+) A-I      intronic
chr7:65348360(+) A-I      intronic
chr7:65409316(+) A-I      intronic
chr7:65343313(+) A-I      intronic
chr7:65368426(+) A-I      intronic
chr7:65402940(+) A-I      intronic
chr7:65370375(+) A-I      intronic
chr7:65374001(+) A-I      intronic
chr7:65364777(+) A-I      intronic
chr7:65406870(+) A-I      intronic
chr7:65358343(+) A-I      intronic
chr7:65405051(+) A-I      intronic
chr7:65410211(+) A-I      intronic
chr7:65369357(+) A-I      intronic
chr7:65368666(+) A-I      intronic
chr7:65344924(+) A-I      intronic
chr7:65358308(+) A-I      intronic
chr7:65391345(+) A-I      intronic
chr7:65347245(+) A-I      intronic
chr7:65344925(+) A-I      intronic
chr7:65371166(+) A-I      intronic
chr7:65402939(+) A-I      intronic
chr7:65361824(+) A-I      intronic
chr7:65344939(+) A-I      intronic
chr7:65386507(+) A-I      intronic
chr7:65340460(+) A-I      intronic
chr7:65368254(+) A-I      intronic
chr7:65360947(+) A-I      intronic
chr7:65380873(+) A-I      intronic
chr7:65379323(+) A-I      intronic
chr7:65339446(+) A-I      intronic
chr7:65379812(+) A-I      intronic
chr7:65358275(+) A-I      intronic
chr7:65361091(+) A-I      intronic
chr7:65406862(+) A-I      intronic
chr7:65367902(+) A-I      intronic
chr7:65342509(+) A-I      intronic
chr7:65391242(+) A-I      intronic
chr7:65339461(+) A-I      intronic
chr7:65343287(+) A-I      intronic
chr7:65368033(+) A-I      intronic
chr7:65410520(+) A-I      intronic
chr7:65359507(+) A-I      intronic
chr7:65341438(+) A-I      intronic
chr7:65346865(+) A-I      intronic
chr7:65406222(+) A-I      intronic
chr7:65400539(+) A-I      intronic
chr7:65386502(+) A-I      intronic
chr7:65359813(+) A-I      intronic
chr7:65400423(+) A-I      intronic
chr7:65342556(+) A-I      intronic
chr7:65409341(+) A-I      intronic
chr7:65351556(+) A-I      intronic
chr7:65341433(+) A-I      intronic
chr7:65341369(+) A-I      intronic
chr7:65340485(+) A-I      intronic
chr7:65386872(+) A-I      intronic
chr7:65340534(+) A-I      intronic
chr7:65340544(+) A-I      intronic
chr7:65386572(+) A-I      intronic
chr7:65379144(+) A-I      intronic
chr7:65363175(+) A-I      intronic
chr7:65361012(+) A-I      intronic
chr7:65392135(+) A-I      intronic
chr7:65361907(+) A-I      intronic
chr7:65351941(+) A-I      intronic
chr7:65341355(+) A-I      intronic
chr7:65412046(+) A-I      intronic
chr7:65414585(+) A-I      intronic
chr7:65347315(+) A-I      intronic
chr7:65402480(+) A-I      intronic
chr7:65361839(+) A-I      intronic
chr7:65368691(+) A-I      intronic
chr7:65373636(+) A-I      intronic
chr7:65397894(+) A-I      intronic
chr7:65418840(+) A-I      intronic
chr7:65365337(+) A-I      intronic
chr7:65345002(+) A-I      intronic
chr7:65400477(+) A-I      intronic
chr7:65342435(+) A-I      intronic
chr7:65391282(+) A-I      intronic
chr7:65358274(+) A-I      intronic
chr7:65365741(+) A-I      intronic
chr7:65397359(+) A-I      intronic
chr7:65361022(+) A-I      intronic
chr7:65344980(+) A-I      intronic
chr7:65342409(+) A-I      intronic
chr7:65365534(+) A-I      intronic
chr7:65369466(+) A-I      intronic
chr7:65368351(+) A-I      intronic
chr7:65383926(+) A-I      intronic
chr7:65365189(+) A-I      intronic
chr7:65348222(+) A-I      intronic
chr7:65343161(+) A-I      intronic
chr7:65358434(+) A-I      intronic
chr7:65400436(+) A-I      intronic
chr7:65372242(+) A-I      intronic
chr7:65387454(+) A-I      intronic
chr7:65379935(+) A-I      intronic
chr7:65374206(+) A-I      intronic
chr7:65388187(+) A-I      intronic
chr7:65410198(+) A-I      intronic
chr7:65364828(+) A-I      intronic
chr7:65346905(+) A-I      intronic
chr7:65365625(+) A-I      intronic
chr7:65344913(+) A-I      intronic
chr7:65400397(+) A-I      intronic
chr7:65358998(+) A-I      intronic
chr7:65340424(+) A-I      intronic
chr7:65344950(+) A-I      intronic
chr7:65394127(+) A-I      intronic
chr7:65406792(+) A-I      intronic
chr7:65348318(+) A-I      intronic
chr7:65352018(+) A-I      intronic
chr7:65359087(+) A-I      intronic
chr7:65368514(+) A-I      intronic
chr7:65402520(+) A-I      intronic
chr7:65386861(+) A-I      intronic
chr7:65340589(+) A-I      intronic
chr7:65342474(+) A-I      intronic
chr7:65388269(+) A-I      intronic
chr7:65361126(+) A-I      intronic
chr7:65374834(+) A-I      intronic
chr7:65410181(+) A-I      intronic
chr7:65368608(+) A-I      intronic
chr7:65391403(+) A-I      intronic
chr7:65402446(+) A-I      intronic
chr7:65406382(+) A-I      intronic
chr7:65349556(+) A-I      intronic
chr7:65379972(+) A-I      intronic
chr7:65418722(+) A-I      intronic
chr7:65374160(+) A-I      intronic
chr7:65339628(+) A-I      intronic
chr7:65394313(+) A-I      intronic
chr7:65409168(+) A-I      intronic
chr7:65406376(+) A-I      intronic
chr7:65352047(+) A-I      intronic
chr7:65359046(+) A-I      intronic
chr7:65372366(+) A-I      intronic
chr7:65358457(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED VKORC1L1
chr7:65367902(+) A-I intron -    22327324
chr7:65399770(+) A-I intron -    22028664
chr7:65399800(+) A-I intron -    22028664
chr7:65399808(+) A-I intron -    22028664
chr7:65399809(+) A-I intron -    22028664
chr7:65399817(+) A-I intron -    22028664
chr7:65399825(+) A-I intron -    22028664
chr7:65399830(+) A-I intron -    22028664
chr7:65399844(+) A-I intron -    22028664
chr7:65399853(+) A-I intron -    22028664
chr7:65399854(+) A-I intron -    22028664
chr7:65399858(+) A-I intron -    22028664
chr7:65339387(+) A-G intron -    22484847
chr7:65339424(+) A-G intron -    22484847
chr7:65339446(+) A-G intron -    22484847
chr7:65339461(+) A-G intron -    22484847
chr7:65339628(+) A-G intron -    22484847
chr7:65339646(+) A-G intron -    22484847
chr7:65340424(+) A-G intron -    22484847
chr7:65340460(+) A-G intron -    22484847
chr7:65340469(+) A-G intron -    22484847
chr7:65340534(+) A-G intron -    22484847
chr7:65340544(+) A-G intron -    22484847
chr7:65340589(+) A-G intron -    22484847
chr7:65340611(+) A-G intron -    22484847
chr7:65340666(+) A-G intron -    22484847
chr7:65341303(+) A-G intron -    22484847
chr7:65341304(+) A-G intron -    22484847
chr7:65341355(+) A-G intron -    22484847
chr7:65341368(+) A-G intron -    22484847
chr7:65341369(+) A-G intron -    22484847
chr7:65341433(+) A-G intron -    22484847
chr7:65341438(+) A-G intron -    22484847
chr7:65342404(+) A-G intron -    22484847
chr7:65342409(+) A-G intron -    22484847
chr7:65342435(+) A-G intron -    22484847
chr7:65342439(+) A-G intron -    22484847
chr7:65342464(+) A-G intron -    22484847
chr7:65342474(+) A-G intron -    22484847
chr7:65342509(+) A-G intron -    22484847
chr7:65342524(+) A-G intron -    22484847
chr7:65342556(+) A-G intron -    22484847
chr7:65343161(+) A-G intron -    22484847
chr7:65343287(+) A-G intron -    22484847
chr7:65343313(+) A-G intron -    22484847
chr7:65343378(+) A-G intron -    22484847
chr7:65343379(+) A-G intron -    22484847
chr7:65343728(+) A-G intron -    22484847
chr7:65343750(+) A-G intron -    22484847
chr7:65343810(+) A-G intron -    22484847
chr7:65344870(+) A-G intron -    22484847
chr7:65344924(+) A-G intron -    22484847
chr7:65344925(+) A-G intron -    22484847
chr7:65344939(+) A-G intron -    22484847
chr7:65344943(+) A-G intron -    22484847
chr7:65344950(+) A-G intron -    22484847
chr7:65344951(+) A-G intron -    22484847
chr7:65344980(+) A-G intron -    22484847
chr7:65345002(+) A-G intron -    22484847
chr7:65345062(+) A-G intron -    22484847
chr7:65345103(+) A-G intron -    22484847
chr7:65346865(+) A-G intron -    22484847
chr7:65346905(+) A-G intron -    22484847
chr7:65346933(+) A-G intron -    22484847
chr7:65346946(+) A-G intron -    22484847
chr7:65346982(+) A-G intron -    22484847
chr7:65347315(+) A-G intron -    22484847
chr7:65348222(+) A-G intron -    22484847
chr7:65348229(+) A-G intron -    22484847
chr7:65348268(+) A-G intron -    22484847
chr7:65348580(+) A-G intron -    22484847
chr7:65348667(+) A-G intron -    22484847
chr7:65348668(+) A-G intron -    22484847
chr7:65348696(+) A-G intron -    22484847
chr7:65349459(+) A-G intron -    22484847
chr7:65351556(+) A-G intron -    22484847
chr7:65351937(+) A-G intron -    22484847
chr7:65351941(+) A-G intron -    22484847
chr7:65352021(+) A-G intron -    22484847
chr7:65352043(+) A-G intron -    22484847
chr7:65352047(+) A-G intron -    22484847
chr7:65354956(+) T-G intron -    22484847
chr7:65355325(+) A-G intron -    22484847
chr7:65358268(+) A-G intron -    22484847
chr7:65358274(+) A-G intron -    22484847
chr7:65358275(+) A-G intron -    22484847
chr7:65358309(+) A-G intron -    22484847
chr7:65358343(+) A-G intron -    22484847
chr7:65358434(+) A-G intron -    22484847
chr7:65358449(+) A-G intron -    22484847
chr7:65358457(+) A-G intron -    22484847
chr7:65358469(+) A-G intron -    22484847
chr7:65358617(+) G-A intron -    22484847
chr7:65358959(+) G-T intron -    22484847
chr7:65358998(+) A-G intron -    22484847
chr7:65359046(+) A-G intron -    22484847
chr7:65359059(+) A-G intron -    22484847
chr7:65359071(+) A-G intron -    22484847
chr7:65359081(+) A-G intron -    22484847
chr7:65359087(+) A-G intron -    22484847
chr7:65359107(+) A-G intron -    22484847
chr7:65359507(+) A-G intron -    22484847
chr7:65359537(+) A-G intron -    22484847
chr7:65359538(+) A-G intron -    22484847
chr7:65359660(+) A-G intron -    22484847
chr7:65360947(+) A-G intron -    22484847
chr7:65360982(+) A-G intron -    22484847
chr7:65360983(+) A-G intron -    22484847
chr7:65361091(+) A-G intron -    22484847
chr7:65361126(+) A-G intron -    22484847
chr7:65361730(+) A-G intron -    22484847
chr7:65361759(+) A-G intron -    22484847
chr7:65361779(+) A-G intron -    22484847
chr7:65361833(+) A-G intron -    22484847
chr7:65361849(+) A-G intron -    22484847
chr7:65361893(+) A-G intron -    22484847
chr7:65361907(+) A-G intron -    22484847
chr7:65363129(+) A-G intron -    22484847
chr7:65363175(+) A-G intron -    22484847
chr7:65363176(+) A-G intron -    22484847
chr7:65363179(+) A-G intron -    22484847
chr7:65363180(+) A-G intron -    22484847
chr7:65363239(+) A-G intron -    22484847
chr7:65363254(+) A-G intron -    22484847
chr7:65363271(+) A-G intron -    22484847
chr7:65364777(+) A-G intron -    22484847
chr7:65364828(+) A-G intron -    22484847
chr7:65364840(+) A-G intron -    22484847
chr7:65364942(+) A-G intron -    22484847
chr7:65365189(+) A-G intron -    22484847
chr7:65365619(+) A-G intron -    22484847
chr7:65365724(+) A-G intron -    22484847
chr7:65367890(+) A-G intron -    22484847
chr7:65367902(+) A-G intron -    22484847
chr7:65367918(+) A-G intron -    22484847
chr7:65367953(+) A-G intron -    22484847
chr7:65367954(+) A-G intron -    22484847
chr7:65367983(+) A-G intron -    22484847
chr7:65368115(+) A-G intron -    22484847
chr7:65368181(+) A-G intron -    22484847
chr7:65368187(+) A-G intron -    22484847
chr7:65368254(+) A-G intron -    22484847
chr7:65368280(+) A-G intron -    22484847
chr7:65368344(+) A-G intron -    22484847
chr7:65368351(+) A-G intron -    22484847
chr7:65368514(+) A-G intron -    22484847
chr7:65368666(+) A-G intron -    22484847
chr7:65368679(+) A-G intron -    22484847
chr7:65369215(+) A-G intron -    22484847
chr7:65369219(+) A-G intron -    22484847
chr7:65369249(+) A-G intron -    22484847
chr7:65369254(+) A-G intron -    22484847
chr7:65369270(+) A-G intron -    22484847
chr7:65369389(+) A-G intron -    22484847
chr7:65369444(+) A-G intron -    22484847
chr7:65369466(+) A-G intron -    22484847
chr7:65370299(+) A-G intron -    22484847
chr7:65370367(+) A-G intron -    22484847
chr7:65370375(+) A-G intron -    22484847
chr7:65370397(+) A-G intron -    22484847
chr7:65371166(+) A-G intron -    22484847
chr7:65371167(+) A-G intron -    22484847
chr7:65371188(+) A-G intron -    22484847
chr7:65371207(+) A-G intron -    22484847
chr7:65372214(+) A-G intron -    22484847
chr7:65372242(+) A-G intron -    22484847
chr7:65372366(+) A-G intron -    22484847
chr7:65373144(+) A-G intron -    22484847
chr7:65373609(+) A-G intron -    22484847
chr7:65373636(+) A-G intron -    22484847
chr7:65373637(+) A-G intron -    22484847
chr7:65373647(+) A-G intron -    22484847
chr7:65374001(+) A-G intron -    22484847
chr7:65374002(+) A-G intron -    22484847
chr7:65374091(+) A-G intron -    22484847
chr7:65374094(+) A-G intron -    22484847
chr7:65374103(+) A-G intron -    22484847
chr7:65374154(+) A-G intron -    22484847
chr7:65374191(+) A-G intron -    22484847
chr7:65374206(+) A-G intron -    22484847
chr7:65374218(+) A-G intron -    22484847
chr7:65374834(+) A-G intron -    22484847
chr7:65377087(+) A-G intron -    22484847
chr7:65378477(+) T-C intron -    22484847
chr7:65379136(+) A-G intron -    22484847
chr7:65379144(+) A-G intron -    22484847
chr7:65379181(+) A-G intron -    22484847
chr7:65379272(+) A-G intron -    22484847
chr7:65379279(+) A-G intron -    22484847
chr7:65379286(+) A-G intron -    22484847
chr7:65379298(+) A-G intron -    22484847
chr7:65379323(+) A-G intron -    22484847
chr7:65379324(+) A-G intron -    22484847
chr7:65379350(+) A-G intron -    22484847
chr7:65379731(+) A-G intron -    22484847
chr7:65379732(+) A-G intron -    22484847
chr7:65379746(+) A-G intron -    22484847
chr7:65379786(+) A-T intron -    22484847
chr7:65379890(+) A-G intron -    22484847
chr7:65379980(+) A-G intron -    22484847
chr7:65379981(+) A-G intron -    22484847
chr7:65380079(+) T-C intron -    22484847
chr7:65380277(+) A-G intron -    22484847
chr7:65380285(+) A-G intron -    22484847
chr7:65380517(+) T-C intron -    22484847
chr7:65380873(+) A-G intron -    22484847
chr7:65386390(+) A-G intron -    22484847
chr7:65386397(+) A-G intron -    22484847
chr7:65386502(+) A-G intron -    22484847
chr7:65386512(+) A-G intron -    22484847
chr7:65386859(+) A-G intron -    22484847
chr7:65386861(+) A-G intron -    22484847
chr7:65386872(+) A-G intron -    22484847
chr7:65388269(+) A-G intron -    22484847
chr7:65391204(+) A-G intron -    22484847
chr7:65391242(+) A-G intron -    22484847
chr7:65391282(+) A-G intron -    22484847
chr7:65391345(+) A-G intron -    22484847
chr7:65391403(+) A-G intron -    22484847
chr7:65392135(+) A-G intron -    22484847
chr7:65392137(+) A-G intron -    22484847
chr7:65394127(+) A-G intron -    22484847
chr7:65394313(+) A-G intron -    22484847
chr7:65396673(+) A-G intron -    22484847
chr7:65397812(+) A-G intron -    22484847
chr7:65397889(+) A-G intron -    22484847
chr7:65397894(+) A-G intron -    22484847
chr7:65399800(+) A-G intron -    22484847
chr7:65399858(+) A-G intron -    22484847
chr7:65399869(+) G-A intron -    22484847
chr7:65400390(+) A-G intron -    22484847
chr7:65400391(+) A-G intron -    22484847
chr7:65400397(+) A-G intron -    22484847
chr7:65400423(+) A-G intron -    22484847
chr7:65400426(+) A-G intron -    22484847
chr7:65400436(+) A-G intron -    22484847
chr7:65402446(+) A-G intron -    22484847
chr7:65402480(+) A-G intron -    22484847
chr7:65402493(+) A-G intron -    22484847
chr7:65402514(+) A-G intron -    22484847
chr7:65402520(+) A-G intron -    22484847
chr7:65402620(+) A-G intron -    22484847
chr7:65402939(+) A-G intron -    22484847
chr7:65402940(+) A-G intron -    22484847
chr7:65403033(+) G-A intron -    22484847
chr7:65403075(+) A-G intron -    22484847
chr7:65405221(+) A-G intron -    22484847
chr7:65406117(+) A-G intron -    22484847
chr7:65406292(+) A-G intron -    22484847
chr7:65406338(+) A-G intron -    22484847
chr7:65406700(+) A-G intron -    22484847
chr7:65407213(+) A-G intron -    22484847
chr7:65407639(+) A-G intron -    22484847
chr7:65407642(+) A-G intron -    22484847
chr7:65408636(+) A-G intron -    22484847
chr7:65409168(+) A-G intron -    22484847
chr7:65409316(+) A-G intron -    22484847
chr7:65409341(+) A-G intron -    22484847
chr7:65409635(+) A-G intron -    22484847
chr7:65412046(+) A-G intron -    22484847
chr7:65412110(+) A-G intron -    22484847
chr7:65412807(+) A-G intron -    22484847
chr7:65417915(+) A-G intron -    22484847
chr7:65417967(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase VKORC1L1
chr7:65338485-65338486(+) m6A CDS       24209618
chr7:65419201-65419202(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr7:65419282-65419283(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr7:65419297-65419298(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr7:65419387-65419388(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr7:65419409-65419410(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22608085
chr7:65419514-65419515(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22608085
chr7:65419854-65419855(+) m6A 3'UTR       -
chr7:65420454-65420455(+) m6A 3'UTR       24284625
chr7:65420521-65420522(+) m6A 3'UTR       24284625//26404942
chr7:65421133-65421134(+) m6A 3'UTR       24981863
chr7:65422268-65422269(+) m6A 3'UTR       24284625
chr7:65422291-65422292(+) m6A 3'UTR       24284625
chr7:65422397-65422398(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr7:65422457-65422458(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22608085
chr7:65422488-65422489(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22608085
chr7:65422504-65422505(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22608085
chr7:65422510-65422511(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22608085
chr7:65422527-65422528(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22608085
chr7:65422643-65422644(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863//22608085
chr7:65423581-65423582(+) m6A 3'UTR       24981863
chr7:65423602-65423603(+) m6A 3'UTR       24981863
chr7:65423958-65423959(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr7:65423986-65423987(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr7:65424000-65424001(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr7:65424091-65424092(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863//22608085
chr7:65424114-65424115(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863//22608085
chr7:65424212-65424213(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863//22608085
chr7:65424281-65424282(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863//22608085
chr7:65424301-65424302(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863//27773535//22608085
chr7:65424308-65424309(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863//27773535//22608085
chr7:65424326-65424327(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863//27773535//22608085
chr7:65424410-65424411(+) m6A 3'UTR       24981863//27773535//22608085
chr7:65424417-65424418(+) m6A 3'UTR       24981863//27773535//22608085
chr7:65424435-65424436(+) m6A 3'UTR       24981863//27773535//22608085
chr7:65424487-65424488(+) m6A 3'UTR       24981863//27773535//22608085
chr7:65424530-65424531(+) m6A 3'UTR       27773535//22608085

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate hsa-miR-100-3p
Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     -
Microvesicle Fibroblasts|Mesenchymal stem cells     -
VKORC1L1
Chromatin K562 cells     -
Endoplasmic reticulum Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Exosome Blood     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus K562 cells     -

Related Drug Information:


Resource Symbol Drug Name PubChem ID PMID
NoncoRNA hsa-miR-100-3p
Methyl (9R,10S,11S,12R,19R)-11-acetyloxy-12-ethyl-4-[(13S,15R,17S)-17-ethyl-17-hydroxy-13-methoxycarbonyl-1,11-diazatetracyclo[13.3.1.04,12.05,10]nonadeca-4(12),5,7,9-tetraen-13-yl]-8-formyl-10-hydroxy-5-methoxy-8,16-diazapentacyclo[10.6.1.01,9.02,7.016,19]nonadeca-2,4,6,13-tetraene-10-carboxylate 134755071       26617885

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hsa-miR-100-3p
Interactor2: VKORC1L1

Evidence Support:


Weak-Evidence RNA-Seq
Prediction-Evidence DIANA-microT//Targetscan
Support Database ViRBase

References:


PMID 31570108 Target region None
Source ViRBase Interactor1 expression None
Tissue or cell line ARPE-19 human RPE cells Interactor2 expression None
Description Table 1 List of miRNAs that were differentially expressed between EBOV- and mock-infected human RPE cells at 24 h post-infection.Putative target genes in EBOV-infected human RPE cells were predicted from the 15 highly differentially expressed miRNAs using algorithms: 2629 targets by Diana microT; 1799 targets by miRDB; and 14315 targets by TargetScan (Additional file 5).

Starting a new search, please wait ...