Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | hsa-miR-100-3p | SOCS5 |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0004512 | 9655 |
Organism | Homo sapiens | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | CIS6//Cish5//CISH6//SOCS-5 |
Resource | Symbol | SNP ID | SNP Position | Ref/Alt | |||||||||||||||||||||||||||
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miRNASNP-v3 | hsa-miR-100-3p |
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Resource | Symbol | Editing Position | |||||||
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Lncediting | SOCS5 |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RADAR | SOCS5 |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID |
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DARNED | SOCS5 |
Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | SOCS5 |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | ||||||
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RNALocate | hsa-miR-100-3p |
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SOCS5 |
Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID | PMID | |||
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NoncoRNA | hsa-miR-100-3p |
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Interactor1: hsa-miR-100-3p | Interactor2: SOCS5 |
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Weak-Evidence | RNA-Seq | |
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Prediction-Evidence | miRDB//Targetscan | |
Support Database | ViRBase |
PMID | 31570108 | Target region | None |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | ARPE-19 human RPE cells | Interactor2 expression | None |
Description | Table 1 List of miRNAs that were differentially expressed between EBOV- and mock-infected human RPE cells at 24 h post-infection.Putative target genes in EBOV-infected human RPE cells were predicted from the 15 highly differentially expressed miRNAs using algorithms: 2629 targets by Diana microT; 1799 targets by miRDB; and 14315 targets by TargetScan (Additional file 5). |