Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

HHID00008238

  Virus:  

Zaire ebolavirus (ZEBOV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.5908

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-100-3p:           SLC25A12:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hsa-miR-100-3p SLC25A12
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0004512 8604
Organism Homo sapiens Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - AGC1//ARALAR//DEE39//EIEE39

ncRNA SNP information:


Resource Symbol SNP ID SNP Position Ref/Alt
miRNASNP-v3 hsa-miR-100-3p
rs1388368183 chr11:122152253    A/G
rs530428149 chr11:122152245    C/T
rs749039221 chr11:122152247    A/G
rs775253529 chr11:122152245    CTA/C
rs909526986 chr11:122152248    T/C
rs1321972926 chr11:122152258    C/T
rs770590792 chr11:122152255    A/G
rs773933142 chr11:122152260    T/C
rs773933142 chr11:122152260    T/G

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR SLC25A12
chr2:172708213(-) A-I      intronic
chr2:172646056(-) A-I      intronic
chr2:172708173(-) A-I      intronic
chr2:172705520(-) A-I      intronic
chr2:172646855(-) A-I      intronic
chr2:172646869(-) A-I      intronic
chr2:172646878(-) A-I      intronic
chr2:172646822(-) A-I      intronic
chr2:172841999(-) A-I      intronic
chr2:172646178(-) A-I      intronic
chr2:172672803(-) A-I      intronic
chr2:172677718(-) A-I      intronic
chr2:172858752(-) A-I      intronic
chr2:172677696(-) A-I      intronic
chr2:172677672(-) A-I      intronic
chr2:172677684(-) A-I      intronic
chr2:172671194(-) A-I      intronic
chr2:172677712(-) A-I      intronic
chr2:172646179(-) A-I      intronic
chr2:172661387(-) A-I      intronic
chr2:172677719(-) A-I      intronic
chr2:172705543(-) A-I      intronic
chr2:172707832(-) A-I      intronic
chr2:172707836(-) A-I      intronic
chr2:172708218(-) A-I      intronic
chr2:172710153(-) A-I      intronic
chr2:172716457(-) A-I      intronic
chr2:172708233(-) A-I      intronic
chr2:172708239(-) A-I      intronic
chr2:172718049(-) A-I      intronic
chr2:172718112(-) A-I      intronic
chr2:172646159(-) A-I      intronic
chr2:172707769(-) A-I      intronic
chr2:172707761(-) A-I      intronic
chr2:172706948(-) A-I      intronic
chr2:172717012(-) A-I      intronic
chr2:172706799(-) A-I      intronic
chr2:172706587(-) A-I      intronic
chr2:172683080(-) A-I      intronic
chr2:172682946(-) A-I      intronic
chr2:172682945(-) A-I      intronic
chr2:172681406(-) A-I      intronic
chr2:172680365(-) A-I      intronic
chr2:172679155(-) A-I      intronic
chr2:172679022(-) A-I      intronic
chr2:172677794(-) A-I      intronic
chr2:172660933(-) A-I      intronic
chr2:172677791(-) A-I      intronic
chr2:172677724(-) A-I      intronic
chr2:172677717(-) A-I      intronic
chr2:172677694(-) A-I      intronic
chr2:172677637(-) A-I      intronic
chr2:172677074(-) A-I      intronic
chr2:172677071(-) A-I      intronic
chr2:172675220(-) A-I      intronic
chr2:172737838(-) A-I      intronic
chr2:172675206(-) A-I      intronic
chr2:172675182(-) A-I      intronic
chr2:172675102(-) A-I      intronic
chr2:172675090(-) A-I      intronic
chr2:172675024(-) A-I      intronic
chr2:172674054(-) A-I      intronic
chr2:172674052(-) A-I      intronic
chr2:172673964(-) A-I      intronic
chr2:172740838(-) A-I      intronic
chr2:172740861(-) A-I      intronic
chr2:172740865(-) A-I      intronic
chr2:172740901(-) A-I      intronic
chr2:172741239(-) A-I      intronic
chr2:172741246(-) A-I      intronic
chr2:172741550(-) A-I      intronic
chr2:172741574(-) A-I      intronic
chr2:172741647(-) A-I      intronic
chr2:172743148(-) A-I      intronic
chr2:172747272(-) A-I      intronic
chr2:172780041(-) A-I      intronic
chr2:172800445(-) A-I      intronic
chr2:172673963(-) A-I      intronic
chr2:172672816(-) A-I      intronic
chr2:172662816(-) A-I      intronic
chr2:172662590(-) A-I      intronic
chr2:172662497(-) A-I      intronic
chr2:172661870(-) A-I      intronic
chr2:172661751(-) A-I      intronic
chr2:172661379(-) A-I      intronic
chr2:172802570(-) A-I      intronic
chr2:172661306(-) A-I      intronic
chr2:172661262(-) A-I      intronic
chr2:172661246(-) A-I      intronic
chr2:172660972(-) A-I      intronic
chr2:172660947(-) A-I      intronic
chr2:172660234(-) A-I      intronic
chr2:172658766(-) A-I      intronic
chr2:172658758(-) A-I      intronic
chr2:172658735(-) A-I      intronic
chr2:172652584(-) A-I      intronic
chr2:172649012(-) A-I      intronic
chr2:172645988(-) A-I      intronic
chr2:172645922(-) A-I      intronic
chr2:172645907(-) A-I      intronic
chr2:172819089(-) A-I      intronic
chr2:172802575(-) A-I      intronic
chr2:172806072(-) A-I      intronic
chr2:172806118(-) A-I      intronic
chr2:172819049(-) A-I      intronic
chr2:172826758(-) A-I      intronic
chr2:172826761(-) A-I      intronic
chr2:172826769(-) A-I      intronic
chr2:172839455(-) A-I      intronic
chr2:172839529(-) A-I      intronic
chr2:172839569(-) A-I      intronic
chr2:172839588(-) A-I      intronic
chr2:172839595(-) A-I      intronic
chr2:172840042(-) A-I      intronic
chr2:172840219(-) A-I      intronic
chr2:172840235(-) A-I      intronic
chr2:172841896(-) A-I      intronic
chr2:172841947(-) A-I      intronic
chr2:172841950(-) A-I      intronic
chr2:172696773(-) A-I      intronic
chr2:172845997(-) A-I      intronic
chr2:172846008(-) A-I      intronic
chr2:172855399(-) A-I      intronic
chr2:172717017(-) A-I      intronic
chr2:172717506(-) A-I      intronic
chr2:172717525(-) A-I      intronic
chr2:172717540(-) A-I      intronic
chr2:172718117(-) A-I      intronic
chr2:172716455(-) A-I      intronic
chr2:172819054(-) A-I      intronic
chr2:172716454(-) A-I      intronic
chr2:172718135(-) A-I      intronic
chr2:172718158(-) A-I      intronic
chr2:172719507(-) A-I      intronic
chr2:172719924(-) A-I      intronic
chr2:172719936(-) A-I      intronic
chr2:172719973(-) A-I      intronic
chr2:172716402(-) A-I      intronic
chr2:172716399(-) A-I      intronic
chr2:172715920(-) A-I      intronic
chr2:172714159(-) A-I      intronic
chr2:172708150(-) A-I      intronic
chr2:172708117(-) A-I      intronic
chr2:172707815(-) A-I      intronic
chr2:172705563(-) A-I      intronic
chr2:172705508(-) A-I      intronic
chr2:172705488(-) A-I      intronic
chr2:172700085(-) A-I      intronic
chr2:172699513(-) A-I      intronic
chr2:172699510(-) A-I      intronic
chr2:172699508(-) A-I      intronic
chr2:172699507(-) A-I      intronic
chr2:172699434(-) A-I      intronic
chr2:172697593(-) A-I      intronic
chr2:172727816(-) A-I      intronic
chr2:172727830(-) A-I      intronic
chr2:172728121(-) A-I      intronic
chr2:172737725(-) A-I      intronic
chr2:172707794(-) A-I      intronic
chr2:172707771(-) A-I      intronic
chr2:172687207(-) A-I      intronic
chr2:172708193(-) A-I      intronic
chr2:172706476(-) A-I      intronic
chr2:172706507(-) A-I      intronic
chr2:172707189(-) A-I      intronic
chr2:172681442(-) A-I      intronic
chr2:172852634(-) A-I      intronic
chr2:172697754(-) A-I      intronic
chr2:172673866(-) A-I      intronic
chr2:172680291(-) A-I      intronic
chr2:172707966(-) A-I      intronic
chr2:172862697(-) A-I      intronic
chr2:172660949(-) A-I      intronic
chr2:172752825(-) A-I      intronic
chr2:172707928(-) A-I      intronic
chr2:172678966(-) A-I      intronic
chr2:172747752(-) A-I      intronic
chr2:172675199(-) A-I      intronic
chr2:172716552(-) A-I      intronic
chr2:172706493(-) A-I      intronic
chr2:172710885(-) A-I      intronic
chr2:172660936(-) A-I      intronic
chr2:172747279(-) A-I      intronic
chr2:172677709(-) A-I      intronic
chr2:172707776(-) A-I      intronic
chr2:172677575(-) A-I      intronic
chr2:172672849(-) A-I      intronic
chr2:172710043(-) A-I      intronic
chr2:172706795(-) A-I      intronic
chr2:172707894(-) A-I      intronic
chr2:172662931(-) A-I      intronic
chr2:172705478(-) A-I      intronic
chr2:172700021(-) A-I      intronic
chr2:172710822(-) A-I      intronic
chr2:172747156(-) A-I      intronic
chr2:172742046(-) A-I      intronic
chr2:172653096(-) A-I      intronic
chr2:172661336(-) A-I      intronic
chr2:172854956(-) A-I      intronic
chr2:172674029(-) A-I      intronic
chr2:172747746(-) A-I      intronic
chr2:172676982(-) A-I      intronic
chr2:172855531(-) A-I      intronic
chr2:172852552(-) A-I      intronic
chr2:172709964(-) A-I      intronic
chr2:172741163(-) A-I      intronic
chr2:172747077(-) A-I      intronic
chr2:172709614(-) A-I      intronic
chr2:172696812(-) A-I      intronic
chr2:172705600(-) A-I      intronic
chr2:172717074(-) A-I      intronic
chr2:172708264(-) A-I      intronic
chr2:172862772(-) A-I      intronic
chr2:172705497(-) A-I      intronic
chr2:172711038(-) A-I      intronic
chr2:172705698(-) A-I      intronic
chr2:172717004(-) A-I      intronic
chr2:172697955(-) A-I      intronic
chr2:172672644(-) A-I      intronic
chr2:172673855(-) A-I      intronic
chr2:172708183(-) A-I      intronic
chr2:172708112(-) A-I      intronic
chr2:172672755(-) A-I      intronic
chr2:172718193(-) A-I      intronic
chr2:172710920(-) A-I      intronic
chr2:172672848(-) A-I      intronic
chr2:172747065(-) A-I      intronic
chr2:172660937(-) A-I      intronic
chr2:172661046(-) A-I      intronic
chr2:172645752(-) A-I      intronic
chr2:172708317(-) A-I      intronic
chr2:172754919(-) A-I      intronic
chr2:172706418(-) A-I      intronic
chr2:172645656(-) A-I      intronic
chr2:172681402(-) A-I      intronic
chr2:172708147(-) A-I      intronic
chr2:172705637(-) A-I      intronic
chr2:172646011(-) A-I      intronic
chr2:172680258(-) A-I      intronic
chr2:172706763(-) A-I      intronic
chr2:172850614(-) A-I      intronic
chr2:172710933(-) A-I      intronic
chr2:172706533(-) A-I      intronic
chr2:172674003(-) A-I      intronic
chr2:172710995(-) A-I      intronic
chr2:172752812(-) A-I      intronic
chr2:172740509(-) A-I      intronic
chr2:172647320(-) A-I      intronic
chr2:172677636(-) A-I      intronic
chr2:172696890(-) A-I      intronic
chr2:172707266(-) A-I      intronic
chr2:172705553(-) A-I      intronic
chr2:172681411(-) A-I      intronic
chr2:172719912(-) A-I      intronic
chr2:172705653(-) A-I      intronic
chr2:172741233(-) A-I      intronic
chr2:172708099(-) A-I      intronic
chr2:172717995(-) A-I      intronic
chr2:172706993(-) A-I      intronic
chr2:172717568(-) A-I      intronic
chr2:172677632(-) A-I      intronic
chr2:172748824(-) A-I      intronic
chr2:172706693(-) A-I      intronic
chr2:172661331(-) A-I      intronic
chr2:172708263(-) A-I      intronic
chr2:172696819(-) A-I      intronic
chr2:172653093(-) A-I      intronic
chr2:172850633(-) A-I      intronic
chr2:172700470(-) A-I      intronic
chr2:172716415(-) A-I      intronic
chr2:172675160(-) A-I      intronic
chr2:172672744(-) A-I      intronic
chr2:172707793(-) A-I      intronic
chr2:172673946(-) A-I      intronic
chr2:172716498(-) A-I      intronic
chr2:172708318(-) A-I      intronic
chr2:172708337(-) A-I      intronic
chr2:172687302(-) A-I      intronic
chr2:172661302(-) A-I      intronic
chr2:172705579(-) A-I      intronic
chr2:172707878(-) A-I      intronic
chr2:172718130(-) A-I      intronic
chr2:172672743(-) A-I      intronic
chr2:172645663(-) A-I      intronic
chr2:172672618(-) A-I      intronic
chr2:172855442(-) A-I      intronic
chr2:172661332(-) A-I      intronic
chr2:172707051(-) A-I      intronic
chr2:172700060(-) A-I      intronic
chr2:172719954(-) A-I      intronic
chr2:172855370(-) A-I      intronic
chr2:172778294(-) A-I      intronic
chr2:172862762(-) A-I      intronic
chr2:172673988(-) A-I      intronic
chr2:172706230(-) A-I      intronic
chr2:172681532(-) A-I      intronic
chr2:172707796(-) A-I      intronic
chr2:172707203(-) A-I      intronic
chr2:172716952(-) A-I      intronic
chr2:172680353(-) A-I      intronic
chr2:172719870(-) A-I      intronic
chr2:172705528(-) A-I      intronic
chr2:172708212(-) A-I      intronic
chr2:172681452(-) A-I      intronic
chr2:172672808(-) A-I      intronic
chr2:172707972(-) A-I      intronic
chr2:172719538(-) A-I      intronic
chr2:172672802(-) A-I      intronic
chr2:172716416(-) A-I      intronic
chr2:172679042(-) A-I      intronic
chr2:172705557(-) A-I      intronic
chr2:172645701(-) A-I      intronic
chr2:172734027(-) A-I      intronic
chr2:172645903(-) A-I      intronic
chr2:172707243(-) A-I      intronic
chr2:172677678(-) A-I      intronic
chr2:172680445(-) A-I      intronic
chr2:172647386(-) A-I      intronic
chr2:172707842(-) A-I      intronic
chr2:172661783(-) A-I      intronic
chr2:172706450(-) A-I      intronic
chr2:172660897(-) A-I      intronic
chr2:172717477(-) A-I      intronic
chr2:172642362(-) A-I      intronic
chr2:172679169(-) A-I      intronic
chr2:172662865(-) A-I      intronic
chr2:172678986(-) A-I      intronic
chr2:172705517(-) A-I      intronic
chr2:172687161(-) A-I      intronic
chr2:172707880(-) A-I      intronic
chr2:172734047(-) A-I      intronic
chr2:172719953(-) A-I      intronic
chr2:172646321(-) A-I      intronic
chr2:172709666(-) A-I      intronic
chr2:172710079(-) A-I      intronic
chr2:172700444(-) A-I      intronic
chr2:172662943(-) A-I      intronic
chr2:172677715(-) A-I      intronic
chr2:172710091(-) A-I      intronic
chr2:172707104(-) A-I      intronic
chr2:172707139(-) A-I      intronic
chr2:172862708(-) A-I      intronic
chr2:172710034(-) A-I      intronic
chr2:172862717(-) A-I      intronic
chr2:172742027(-) A-I      intronic
chr2:172706490(-) A-I      intronic
chr2:172710104(-) A-I      intronic
chr2:172716551(-) A-I      intronic
chr2:172710069(-) A-I      intronic
chr2:172710025(-) A-I      intronic
chr2:172707971(-) A-I      intronic
chr2:172725080(-) A-I      intronic
chr2:172740449(-) A-I      intronic
chr2:172708238(-) A-I      intronic
chr2:172661252(-) A-I      intronic
chr2:172705577(-) A-I      intronic
chr2:172707198(-) A-I      intronic
chr2:172710108(-) A-I      intronic
chr2:172679045(-) A-I      intronic
chr2:172706440(-) A-I      intronic
chr2:172716543(-) A-I      intronic
chr2:172700136(-) A-I      intronic
chr2:172706449(-) A-I      intronic
chr2:172681435(-) A-I      intronic
chr2:172706704(-) A-I      intronic
chr2:172677800(-) A-I      intronic
chr2:172680257(-) A-I      intronic
chr2:172661269(-) A-I      intronic
chr2:172715935(-) A-I      intronic
chr2:172708220(-) A-I      intronic
chr2:172776651(-) A-I      intronic
chr2:172698047(-) A-I      intronic
chr2:172716990(-) A-I      intronic
chr2:172705588(-) A-I      intronic
chr2:172716481(-) A-I      intronic
chr2:172855362(-) A-I      intronic
chr2:172707871(-) A-I      intronic
chr2:172855466(-) A-I      intronic
chr2:172715944(-) A-I      intronic
chr2:172855453(-) A-I      intronic
chr2:172710860(-) A-I      intronic
chr2:172699549(-) A-I      intronic
chr2:172710144(-) A-I      intronic
chr2:172710128(-) A-I      intronic
chr2:172722088(-) A-I      intronic
chr2:172733127(-) A-I      intronic
chr2:172661230(-) A-I      intronic
chr2:172715866(-) A-I      intronic
chr2:172672720(-) A-I      intronic
chr2:172706694(-) A-I      intronic
chr2:172709566(-) A-I      intronic
chr2:172716389(-) A-I      intronic
chr2:172705631(-) A-I      intronic
chr2:172716392(-) A-I      intronic
chr2:172708261(-) A-I      intronic
chr2:172776535(-) A-I      intronic
chr2:172764220(-) A-I      intronic
chr2:172675158(-) A-I      intronic
chr2:172647376(-) A-I      intronic
chr2:172852411(-) A-I      intronic
chr2:172705696(-) A-I      intronic
chr2:172710053(-) A-I      intronic
chr2:172706656(-) A-I      intronic
chr2:172675173(-) A-I      intronic
chr2:172747266(-) A-I      intronic
chr2:172706586(-) A-I      intronic
chr2:172754895(-) A-I      intronic
chr2:172672740(-) A-I      intronic
chr2:172677680(-) A-I      intronic
chr2:172677700(-) A-I      intronic
chr2:172645847(-) A-I      intronic
chr2:172764209(-) A-I      intronic
chr2:172700056(-) A-I      intronic
chr2:172747265(-) A-I      intronic
chr2:172850713(-) A-I      intronic
chr2:172677806(-) A-I      intronic
chr2:172705456(-) A-I      intronic
chr2:172707059(-) A-I      intronic
chr2:172716337(-) A-I      intronic
chr2:172709653(-) A-I      intronic
chr2:172661163(-) A-I      intronic
chr2:172703067(-) A-I      intronic
chr2:172716906(-) A-I      intronic
chr2:172677710(-) A-I      intronic
chr2:172697956(-) A-I      intronic
chr2:172710955(-) A-I      intronic
chr2:172706417(-) A-I      intronic
chr2:172709969(-) A-I      intronic
chr2:172708295(-) A-I      intronic
chr2:172716943(-) A-I      intronic
chr2:172717374(-) A-I      intronic
chr2:172856619(-) A-I      intronic
chr2:172742837(-) A-I      intronic
chr2:172710028(-) A-I      intronic
chr2:172708334(-) A-I      intronic
chr2:172707933(-) A-I      intronic
chr2:172661263(-) A-I      intronic
chr2:172706711(-) A-I      intronic
chr2:172662848(-) A-I      intronic
chr2:172705489(-) A-I      intronic
chr2:172707883(-) A-I      intronic
chr2:172672714(-) A-I      intronic
chr2:172679123(-) A-I      intronic
chr2:172709676(-) A-I      intronic
chr2:172673894(-) A-I      intronic
chr2:172680297(-) A-I      intronic
chr2:172705443(-) A-I      intronic
chr2:172705537(-) A-I      intronic
chr2:172707012(-) A-I      intronic
chr2:172719914(-) A-I      intronic
chr2:172742095(-) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED SLC25A12
chr2:172647605(-) A-I intron -    19478186
chr2:172677632(-) A-I intron -    22327324
chr2:172645656(-) A-G intron -    22484847
chr2:172646011(-) A-G intron -    22484847
chr2:172652636(-) A-T intron -    22484847
chr2:172660897(-) A-G intron -    22484847
chr2:172660906(-) A-G intron -    22484847
chr2:172660937(-) A-G intron -    22484847
chr2:172660938(-) A-G intron -    22484847
chr2:172660948(-) A-G intron -    22484847
chr2:172660949(-) A-G intron -    22484847
chr2:172661003(-) A-G intron -    22484847
chr2:172661046(-) A-G intron -    22484847
chr2:172661332(-) A-G intron -    22484847
chr2:172661853(-) A-G intron -    22484847
chr2:172662401(-) A-G intron -    22484847
chr2:172662427(-) A-G intron -    22484847
chr2:172662848(-) A-G intron -    22484847
chr2:172662865(-) A-G intron -    22484847
chr2:172662921(-) A-G intron -    22484847
chr2:172662926(-) A-G intron -    22484847
chr2:172662931(-) A-G intron -    22484847
chr2:172662943(-) A-G intron -    22484847
chr2:172672714(-) A-G intron -    22484847
chr2:172672740(-) A-G intron -    22484847
chr2:172674003(-) A-G intron -    22484847
chr2:172674059(-) A-G intron -    22484847
chr2:172675116(-) A-G intron -    22484847
chr2:172675158(-) A-G intron -    22484847
chr2:172675160(-) A-G intron -    22484847
chr2:172677632(-) A-G intron -    22484847
chr2:172677636(-) A-G intron -    22484847
chr2:172677782(-) A-G intron -    22484847
chr2:172677806(-) A-G intron -    22484847
chr2:172679042(-) A-G intron -    22484847
chr2:172679045(-) A-G intron -    22484847
chr2:172679169(-) A-G intron -    22484847
chr2:172679170(-) A-G intron -    22484847
chr2:172680353(-) A-G intron -    22484847
chr2:172680445(-) A-G intron -    22484847
chr2:172681452(-) A-G intron -    22484847
chr2:172681478(-) A-G intron -    22484847
chr2:172681532(-) A-G intron -    22484847
chr2:172683036(-) A-G intron -    22484847
chr2:172687188(-) A-G intron -    22484847
chr2:172687252(-) A-G intron -    22484847
chr2:172687282(-) A-G intron -    22484847
chr2:172687302(-) A-G intron -    22484847
chr2:172696890(-) A-G intron -    22484847
chr2:172697727(-) A-G intron -    22484847
chr2:172697754(-) A-G intron -    22484847
chr2:172698047(-) A-G intron -    22484847
chr2:172698937(-) A-G intron -    22484847
chr2:172699617(-) A-G intron -    22484847
chr2:172699977(-) A-G intron -    22484847
chr2:172700021(-) A-G intron -    22484847
chr2:172700060(-) A-G intron -    22484847
chr2:172700444(-) A-G intron -    22484847
chr2:172705443(-) A-G intron -    22484847
chr2:172705455(-) A-G intron -    22484847
chr2:172705456(-) A-G intron -    22484847
chr2:172705483(-) A-G intron -    22484847
chr2:172705517(-) A-G intron -    22484847
chr2:172705528(-) A-G intron -    22484847
chr2:172705534(-) A-G intron -    22484847
chr2:172705537(-) A-G intron -    22484847
chr2:172705553(-) A-G intron -    22484847
chr2:172705579(-) A-G intron -    22484847
chr2:172705588(-) A-G intron -    22484847
chr2:172705600(-) A-G intron -    22484847
chr2:172705617(-) A-G intron -    22484847
chr2:172706204(-) A-G intron -    22484847
chr2:172706230(-) A-G intron -    22484847
chr2:172706440(-) A-G intron -    22484847
chr2:172706449(-) A-G intron -    22484847
chr2:172706450(-) A-G intron -    22484847
chr2:172706507(-) A-G intron -    22484847
chr2:172706533(-) A-G intron -    22484847
chr2:172706704(-) A-G intron -    22484847
chr2:172706790(-) A-G intron -    22484847
chr2:172706993(-) A-G intron -    22484847
chr2:172707012(-) A-G intron -    22484847
chr2:172707020(-) A-G intron -    22484847
chr2:172707104(-) A-G intron -    22484847
chr2:172707139(-) A-G intron -    22484847
chr2:172707871(-) A-G intron -    22484847
chr2:172707880(-) A-G intron -    22484847
chr2:172707883(-) A-G intron -    22484847
chr2:172707894(-) A-G intron -    22484847
chr2:172707971(-) A-G intron -    22484847
chr2:172708099(-) A-G intron -    22484847
chr2:172708120(-) A-G intron -    22484847
chr2:172708159(-) G-T intron -    22484847
chr2:172708219(-) C-T intron -    22484847
chr2:172708263(-) A-G intron -    22484847
chr2:172708334(-) A-G intron -    22484847
chr2:172710028(-) A-G intron -    22484847
chr2:172710034(-) A-G intron -    22484847
chr2:172710043(-) A-G intron -    22484847
chr2:172710108(-) A-G intron -    22484847
chr2:172710109(-) A-G intron -    22484847
chr2:172710191(-) G-T intron -    22484847
chr2:172710844(-) G-A intron -    22484847
chr2:172710994(-) A-G intron -    22484847
chr2:172711038(-) A-G intron -    22484847
chr2:172715944(-) A-G intron -    22484847
chr2:172715948(-) A-G intron -    22484847
chr2:172715989(-) A-G intron -    22484847
chr2:172716334(-) A-G intron -    22484847
chr2:172716337(-) A-G intron -    22484847
chr2:172716389(-) A-G intron -    22484847
chr2:172716392(-) A-G intron -    22484847
chr2:172716415(-) A-G intron -    22484847
chr2:172716416(-) A-G intron -    22484847
chr2:172716422(-) A-G intron -    22484847
chr2:172716481(-) A-G intron -    22484847
chr2:172716552(-) A-G intron -    22484847
chr2:172716943(-) A-G intron -    22484847
chr2:172716952(-) A-G intron -    22484847
chr2:172716990(-) A-G intron -    22484847
chr2:172717004(-) A-G intron -    22484847
chr2:172717074(-) A-G intron -    22484847
chr2:172717090(-) A-G intron -    22484847
chr2:172717106(-) A-G intron -    22484847
chr2:172717347(-) A-G intron -    22484847
chr2:172717374(-) A-G intron -    22484847
chr2:172717477(-) A-G intron -    22484847
chr2:172717995(-) A-G intron -    22484847
chr2:172718130(-) A-G intron -    22484847
chr2:172718193(-) A-G intron -    22484847
chr2:172719548(-) A-G intron -    22484847
chr2:172719685(-) A-G intron -    22484847
chr2:172719870(-) A-G intron -    22484847
chr2:172719912(-) A-G intron -    22484847
chr2:172719914(-) A-G intron -    22484847
chr2:172719953(-) A-G intron -    22484847
chr2:172719954(-) A-G intron -    22484847
chr2:172722088(-) A-G intron -    22484847
chr2:172728109(-) A-G intron -    22484847
chr2:172729786(-) T-C intron -    22484847
chr2:172737833(-) A-G intron -    22484847
chr2:172737926(-) A-G intron -    22484847
chr2:172740463(-) A-G intron -    22484847
chr2:172740509(-) A-G intron -    22484847
chr2:172747059(-) A-G intron -    22484847
chr2:172747065(-) A-G intron -    22484847
chr2:172747077(-) A-G intron -    22484847
chr2:172646071(-) A-G intron -    22484847
chr2:172646168(-) A-G intron -    22484847
chr2:172646812(-) A-G intron -    22484847
chr2:172646823(-) A-G intron -    22484847
chr2:172646900(-) A-G intron -    22484847
chr2:172646916(-) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase SLC25A12
chr2:172641606-172641607(-) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085
chr2:172641671-172641672(-) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085
chr2:172641778-172641779(-) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//28052920//22608085
chr2:172641868-172641869(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863
chr2:172641900-172641901(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863
chr2:172644407-172644408(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       -
chr2:172644412-172644413(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       -
chr2:172712430-172712431(-) Y CDS//exon//intron       26075521
chr2:172749727-172749728(-) m6A CDS//exon       24981863
chr2:172749761-172749762(-) m6A CDS//exon       24981863

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate hsa-miR-100-3p
Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     -
Microvesicle Fibroblasts|Mesenchymal stem cells     -
SLC25A12
Chromatin K562 cells     -
Exosome Blood     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus HeLa-S3 cells|K562 cells     -

Related Drug Information:


Resource Symbol Drug Name PubChem ID PMID
NoncoRNA hsa-miR-100-3p
Methyl (9R,10S,11S,12R,19R)-11-acetyloxy-12-ethyl-4-[(13S,15R,17S)-17-ethyl-17-hydroxy-13-methoxycarbonyl-1,11-diazatetracyclo[13.3.1.04,12.05,10]nonadeca-4(12),5,7,9-tetraen-13-yl]-8-formyl-10-hydroxy-5-methoxy-8,16-diazapentacyclo[10.6.1.01,9.02,7.016,19]nonadeca-2,4,6,13-tetraene-10-carboxylate 134755071       26617885

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hsa-miR-100-3p
Interactor2: SLC25A12

Evidence Support:


Weak-Evidence RNA-Seq
Prediction-Evidence miRDB//Targetscan
Support Database ViRBase

References:


PMID 31570108 Target region None
Source ViRBase Interactor1 expression None
Tissue or cell line ARPE-19 human RPE cells Interactor2 expression None
Description Table 1 List of miRNAs that were differentially expressed between EBOV- and mock-infected human RPE cells at 24 h post-infection.Putative target genes in EBOV-infected human RPE cells were predicted from the 15 highly differentially expressed miRNAs using algorithms: 2629 targets by Diana microT; 1799 targets by miRDB; and 14315 targets by TargetScan (Additional file 5).

Starting a new search, please wait ...