Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

HHID00005126

  Virus:  

Zaire ebolavirus (ZEBOV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.6002

  Interaction Type:  

Host-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsa-miR-190a-5p:           YIPF4:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hsa-miR-190a-5p YIPF4
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0000458 84272
Organism Homo sapiens Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - FinGER4//Nbla11189

ncRNA SNP information:


Resource Symbol SNP ID SNP Position Ref/Alt
miRNASNP-v3 hsa-miR-190a-5p
rs1018706777 chr15:62823984    A/G
rs1369926402 chr15:62823991    G/A
rs1555521311 chr15:62823990    G/C
rs755866868 chr15:62823986    A/G
rs766742872 chr15:62823990    GGTT/G
rs777464613 chr15:62823987    T/G
rs1228899174 chr15:62823974    T/A
rs1281303771 chr15:62823976    T/C
rs1350000299 chr15:62823972    G/A

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR YIPF4
chr2:32535317(+) A-I      3'UTR
chr2:32535355(+) A-I      3'UTR
chr2:32532837(+) A-I      3'UTR
chr2:32535675(+) A-I      3'UTR
chr2:32532764(+) A-I      3'UTR
chr2:32535677(+) A-I      3'UTR
chr2:32535680(+) A-I      3'UTR
chr2:32532920(+) A-I      3'UTR
chr2:32532904(+) A-I      3'UTR
chr2:32532894(+) A-I      3'UTR
chr2:32532877(+) A-I      3'UTR
chr2:32535721(+) A-I      3'UTR
chr2:32535741(+) A-I      3'UTR
chr2:32535749(+) A-I      3'UTR
chr2:32535752(+) A-I      3'UTR
chr2:32535770(+) A-I      3'UTR
chr2:32532842(+) A-I      3'UTR
chr2:32535785(+) A-I      3'UTR
chr2:32535886(+) A-I      3'UTR
chr2:32532797(+) A-I      3'UTR
chr2:32532763(+) A-I      3'UTR
chr2:32532750(+) A-I      3'UTR
chr2:32517720(+) A-I      intronic
chr2:32533500(+) A-I      3'UTR
chr2:32533498(+) A-I      3'UTR
chr2:32533486(+) A-I      3'UTR
chr2:32532699(+) A-I      3'UTR
chr2:32533470(+) A-I      3'UTR
chr2:32533234(+) A-I      3'UTR
chr2:32533222(+) A-I      3'UTR
chr2:32533012(+) A-I      3'UTR
chr2:32533006(+) A-I      3'UTR
chr2:32533004(+) A-I      3'UTR
chr2:32533001(+) A-I      3'UTR
chr2:32533000(+) A-I      3'UTR
chr2:32532999(+) A-I      3'UTR
chr2:32532970(+) A-I      3'UTR
chr2:32533544(+) A-I      3'UTR
chr2:32533560(+) A-I      3'UTR
chr2:32533612(+) A-I      3'UTR
chr2:32534894(+) A-I      3'UTR
chr2:32534913(+) A-I      3'UTR
chr2:32534932(+) A-I      3'UTR
chr2:32535042(+) A-I      3'UTR
chr2:32506380(+) A-I      intronic
chr2:32506366(+) A-I      intronic
chr2:32528549(+) A-I      intronic
chr2:32527360(+) A-I      intronic
chr2:32527239(+) A-I      intronic
chr2:32527200(+) A-I      intronic
chr2:32527199(+) A-I      intronic
chr2:32527048(+) A-I      intronic
chr2:32526927(+) A-I      intronic
chr2:32525343(+) A-I      intronic
chr2:32525220(+) A-I      intronic
chr2:32525214(+) A-I      intronic
chr2:32525204(+) A-I      intronic
chr2:32525177(+) A-I      intronic
chr2:32525160(+) A-I      intronic
chr2:32525025(+) A-I      intronic
chr2:32524966(+) A-I      intronic
chr2:32524943(+) A-I      intronic
chr2:32524182(+) A-I      intronic
chr2:32524147(+) A-I      intronic
chr2:32524144(+) A-I      intronic
chr2:32524134(+) A-I      intronic
chr2:32524127(+) A-I      intronic
chr2:32524064(+) A-I      intronic
chr2:32524027(+) A-I      intronic
chr2:32524000(+) A-I      intronic
chr2:32523889(+) A-I      intronic
chr2:32523811(+) A-I      intronic
chr2:32523769(+) A-I      intronic
chr2:32523764(+) A-I      intronic
chr2:32522451(+) A-I      intronic
chr2:32522399(+) A-I      intronic
chr2:32522346(+) A-I      intronic
chr2:32522249(+) A-I      intronic
chr2:32521421(+) A-I      intronic
chr2:32521394(+) A-I      intronic
chr2:32521391(+) A-I      intronic
chr2:32521365(+) A-I      intronic
chr2:32520893(+) A-I      intronic
chr2:32520855(+) A-I      intronic
chr2:32520846(+) A-I      intronic
chr2:32520839(+) A-I      intronic
chr2:32520773(+) A-I      intronic
chr2:32520772(+) A-I      intronic
chr2:32513732(+) A-I      intronic
chr2:32513693(+) A-I      intronic
chr2:32513692(+) A-I      intronic
chr2:32512210(+) A-I      intronic
chr2:32512208(+) A-I      intronic
chr2:32512152(+) A-I      intronic
chr2:32512143(+) A-I      intronic
chr2:32512138(+) A-I      intronic
chr2:32512112(+) A-I      intronic
chr2:32511798(+) A-I      intronic
chr2:32511772(+) A-I      intronic
chr2:32510854(+) A-I      intronic
chr2:32510842(+) A-I      intronic
chr2:32510818(+) A-I      intronic
chr2:32510794(+) A-I      intronic
chr2:32508161(+) A-I      intronic
chr2:32507999(+) A-I      intronic
chr2:32507907(+) A-I      intronic
chr2:32507744(+) A-I      intronic
chr2:32507643(+) A-I      intronic
chr2:32507641(+) A-I      intronic
chr2:32507619(+) A-I      intronic
chr2:32507601(+) A-I      intronic
chr2:32507521(+) A-I      intronic
chr2:32507250(+) A-I      intronic
chr2:32506585(+) A-I      intronic
chr2:32506554(+) A-I      intronic
chr2:32506494(+) A-I      intronic
chr2:32506485(+) A-I      intronic
chr2:32506477(+) A-I      intronic
chr2:32506450(+) A-I      intronic
chr2:32506428(+) A-I      intronic
chr2:32512175(+) A-I      intronic
chr2:32528615(+) A-I      intronic
chr2:32506415(+) A-I      intronic
chr2:32506397(+) A-I      intronic
chr2:32528681(+) A-I      intronic
chr2:32532928(+) A-I      3'UTR
chr2:32532831(+) A-I      3'UTR
chr2:32533200(+) A-I      3'UTR
chr2:32532789(+) A-I      3'UTR
chr2:32532786(+) A-I      3'UTR
chr2:32532776(+) A-I      3'UTR
chr2:32532733(+) A-I      3'UTR
chr2:32532723(+) A-I      3'UTR
chr2:32533519(+) A-I      3'UTR
chr2:32533509(+) A-I      3'UTR
chr2:32533461(+) A-I      3'UTR
chr2:32533386(+) A-I      3'UTR
chr2:32533385(+) A-I      3'UTR
chr2:32535905(+) A-I      3'UTR
chr2:32533258(+) A-I      3'UTR
chr2:32532980(+) A-I      3'UTR
chr2:32533377(+) A-I      3'UTR
chr2:32533582(+) A-I      3'UTR
chr2:32535839(+) A-I      3'UTR
chr2:32533354(+) A-I      3'UTR
chr2:32532987(+) A-I      3'UTR
chr2:32535812(+) A-I      3'UTR
chr2:32535404(+) A-I      3'UTR
chr2:32535381(+) A-I      3'UTR
chr2:32535379(+) A-I      3'UTR
chr2:32532982(+) A-I      3'UTR
chr2:32535378(+) A-I      3'UTR
chr2:32535369(+) A-I      3'UTR
chr2:32535035(+) A-I      3'UTR
chr2:32533344(+) A-I      3'UTR
chr2:32535019(+) A-I      3'UTR
chr2:32533328(+) A-I      3'UTR
chr2:32535002(+) A-I      3'UTR
chr2:32534993(+) A-I      3'UTR
chr2:32534988(+) A-I      3'UTR
chr2:32533253(+) A-I      3'UTR
chr2:32534832(+) A-I      3'UTR
chr2:32534088(+) A-I      3'UTR
chr2:32534050(+) A-I      3'UTR
chr2:32532952(+) A-I      3'UTR
chr2:32534049(+) A-I      3'UTR
chr2:32534045(+) A-I      3'UTR
chr2:32534041(+) A-I      3'UTR
chr2:32534032(+) A-I      3'UTR
chr2:32534021(+) A-I      3'UTR
chr2:32534020(+) A-I      3'UTR
chr2:32534012(+) A-I      3'UTR
chr2:32534006(+) A-I      3'UTR
chr2:32533989(+) A-I      3'UTR
chr2:32535794(+) A-I      3'UTR
chr2:32533985(+) A-I      3'UTR
chr2:32533943(+) A-I      3'UTR
chr2:32533941(+) A-I      3'UTR
chr2:32533939(+) A-I      3'UTR
chr2:32533909(+) A-I      3'UTR
chr2:32533896(+) A-I      3'UTR
chr2:32533893(+) A-I      3'UTR
chr2:32533880(+) A-I      3'UTR
chr2:32533863(+) A-I      3'UTR
chr2:32533703(+) A-I      3'UTR
chr2:32534946(+) A-I      3'UTR
chr2:32533694(+) A-I      3'UTR
chr2:32533688(+) A-I      3'UTR
chr2:32533667(+) A-I      3'UTR
chr2:32533639(+) A-I      3'UTR
chr2:32533631(+) A-I      3'UTR
chr2:32533607(+) A-I      3'UTR
chr2:32533606(+) A-I      3'UTR
chr2:32533603(+) A-I      3'UTR
chr2:32533593(+) A-I      3'UTR
chr2:32533587(+) A-I      3'UTR
chr2:32513719(+) A-I      intronic
chr2:32526914(+) A-I      intronic
chr2:32506896(+) A-I      intronic
chr2:32506889(+) A-I      intronic
chr2:32517743(+) A-I      intronic
chr2:32506919(+) A-I      intronic
chr2:32506853(+) A-I      intronic
chr2:32505052(+) A-I      intronic
chr2:32504223(+) A-I      intronic
chr2:32506905(+) A-I      intronic
chr2:32506698(+) A-I      intronic
chr2:32524635(+) A-I      intronic
chr2:32526957(+) A-I      intronic
chr2:32506892(+) A-I      intronic
chr2:32525292(+) A-I      intronic
chr2:32506876(+) A-I      intronic
chr2:32507107(+) A-I      intronic
chr2:32504245(+) A-I      intronic
chr2:32505529(+) A-I      intronic
chr2:32506927(+) A-I      intronic
chr2:32522257(+) A-I      intronic
chr2:32506718(+) A-I      intronic
chr2:32506808(+) A-I      intronic
chr2:32524721(+) A-I      intronic
chr2:32508025(+) A-I      intronic
chr2:32506914(+) A-I      intronic
chr2:32517775(+) A-I      intronic
chr2:32522604(+) A-I      intronic
chr2:32507563(+) A-I      intronic
chr2:32506806(+) A-I      intronic
chr2:32524775(+) A-I      intronic
chr2:32523901(+) A-I      intronic
chr2:32511732(+) A-I      intronic
chr2:32524047(+) A-I      intronic
chr2:32506801(+) A-I      intronic
chr2:32520892(+) A-I      intronic
chr2:32522333(+) A-I      intronic
chr2:32517830(+) A-I      intronic
chr2:32506411(+) A-I      intronic
chr2:32523657(+) A-I      intronic
chr2:32520790(+) A-I      intronic
chr2:32523903(+) A-I      intronic
chr2:32506909(+) A-I      intronic
chr2:32523767(+) A-I      intronic
chr2:32506870(+) A-I      intronic
chr2:32506913(+) A-I      intronic
chr2:32521443(+) A-I      intronic
chr2:32506779(+) A-I      intronic
chr2:32524076(+) A-I      intronic
chr2:32527180(+) A-I      intronic
chr2:32525224(+) A-I      intronic
chr2:32506885(+) A-I      intronic
chr2:32506781(+) A-I      intronic
chr2:32534884(+) A-I      3'UTR
chr2:32535291(+) A-I      3'UTR
chr2:32533625(+) A-I      3'UTR
chr2:32533210(+) A-I      3'UTR
chr2:32534980(+) A-I      3'UTR
chr2:32535697(+) A-I      3'UTR
chr2:32532742(+) A-I      3'UTR
chr2:32532883(+) A-I      3'UTR
chr2:32534923(+) A-I      3'UTR
chr2:32532838(+) A-I      3'UTR
chr2:32535851(+) A-I      3'UTR
chr2:32532945(+) A-I      3'UTR
chr2:32535900(+) A-I      3'UTR
chr2:32532843(+) A-I      3'UTR
chr2:32532846(+) A-I      3'UTR
chr2:32532840(+) A-I      3'UTR
chr2:32533630(+) A-I      3'UTR
chr2:32534838(+) A-I      3'UTR
chr2:32532844(+) A-I      3'UTR
chr2:32535301(+) A-I      3'UTR
chr2:32533235(+) A-I      3'UTR
chr2:32533596(+) A-I      3'UTR
chr2:32532834(+) A-I      3'UTR
chr2:32533953(+) A-I      3'UTR
chr2:32535865(+) A-I      3'UTR
chr2:32532809(+) A-I      3'UTR
chr2:32533727(+) A-I      3'UTR
chr2:32534931(+) A-I      3'UTR
chr2:32533679(+) A-I      3'UTR
chr2:32532950(+) A-I      3'UTR
chr2:32535336(+) A-I      3'UTR
chr2:32533621(+) A-I      3'UTR
chr2:32533945(+) A-I      3'UTR
chr2:32532818(+) A-I      3'UTR
chr2:32534948(+) A-I      3'UTR
chr2:32534809(+) A-I      3'UTR
chr2:32533440(+) A-I      3'UTR
chr2:32532941(+) A-I      3'UTR
chr2:32534959(+) A-I      3'UTR
chr2:32535331(+) A-I      3'UTR
chr2:32532820(+) A-I      3'UTR
chr2:32535746(+) A-I      3'UTR
chr2:32534861(+) A-I      3'UTR
chr2:32533533(+) A-I      3'UTR
chr2:32535797(+) A-I      3'UTR
chr2:32533778(+) A-I      3'UTR
chr2:32533452(+) A-I      3'UTR
chr2:32534979(+) A-I      3'UTR
chr2:32534075(+) A-I      3'UTR
chr2:32535805(+) A-I      3'UTR
chr2:32533206(+) A-I      3'UTR
chr2:32534802(+) A-I      3'UTR
chr2:32535318(+) A-I      3'UTR
chr2:32533259(+) A-I      3'UTR
chr2:32535832(+) A-I      3'UTR
chr2:32535828(+) A-I      3'UTR
chr2:32533632(+) A-I      3'UTR
chr2:32535041(+) A-I      3'UTR
chr2:32535783(+) A-I      3'UTR
chr2:32535708(+) A-I      3'UTR
chr2:32533360(+) A-I      3'UTR
chr2:32535020(+) A-I      3'UTR
chr2:32535685(+) A-I      3'UTR
chr2:32535309(+) A-I      3'UTR
chr2:32532949(+) A-I      3'UTR
chr2:32534858(+) A-I      3'UTR
chr2:32532719(+) A-I      3'UTR
chr2:32535315(+) A-I      3'UTR
chr2:32535033(+) A-I      3'UTR
chr2:32534924(+) A-I      3'UTR
chr2:32534885(+) A-I      3'UTR
chr2:32533345(+) A-I      3'UTR
chr2:32532887(+) A-I      3'UTR
chr2:32533707(+) A-I      3'UTR
chr2:32532747(+) A-I      3'UTR
chr2:32533597(+) A-I      3'UTR
chr2:32532911(+) A-I      3'UTR
chr2:32535310(+) A-I      3'UTR
chr2:32533243(+) A-I      3'UTR
chr2:32535287(+) A-I      3'UTR
chr2:32533762(+) A-I      3'UTR
chr2:32533627(+) A-I      3'UTR
chr2:32533946(+) A-I      3'UTR
chr2:32533318(+) A-I      3'UTR
chr2:32535692(+) A-I      3'UTR
chr2:32533204(+) A-I      3'UTR
chr2:32532800(+) A-I      3'UTR
chr2:32533857(+) A-I      3'UTR
chr2:32532845(+) A-I      3'UTR
chr2:32533283(+) A-I      3'UTR
chr2:32535847(+) A-I      3'UTR
chr2:32535777(+) A-I      3'UTR
chr2:32535738(+) A-I      3'UTR
chr2:32535857(+) A-I      3'UTR
chr2:32534897(+) A-I      3'UTR
chr2:32534939(+) A-I      3'UTR
chr2:32535950(+) A-I      3'UTR
chr2:32533622(+) A-I      3'UTR
chr2:32534862(+) A-I      3'UTR
chr2:32534868(+) A-I      3'UTR
chr2:32534968(+) A-I      3'UTR
chr2:32533979(+) A-I      3'UTR
chr2:32532765(+) A-I      3'UTR
chr2:32534821(+) A-I      3'UTR
chr2:32532812(+) A-I      3'UTR
chr2:32532878(+) A-I      3'UTR
chr2:32533240(+) A-I      3'UTR
chr2:32532849(+) A-I      3'UTR
chr2:32535383(+) A-I      3'UTR
chr2:32532741(+) A-I      3'UTR
chr2:32533439(+) A-I      3'UTR
chr2:32533554(+) A-I      3'UTR
chr2:32535006(+) A-I      3'UTR
chr2:32533528(+) A-I      3'UTR
chr2:32533661(+) A-I      3'UTR
chr2:32534940(+) A-I      3'UTR
chr2:32534827(+) A-I      3'UTR
chr2:32532988(+) A-I      3'UTR
chr2:32534822(+) A-I      3'UTR
chr2:32534837(+) A-I      3'UTR
chr2:32521481(+) A-I      intronic
chr2:32524807(+) A-I      intronic
chr2:32524211(+) A-I      intronic
chr2:32520798(+) A-I      intronic
chr2:32507231(+) A-I      intronic
chr2:32522339(+) A-I      intronic
chr2:32506771(+) A-I      intronic
chr2:32528176(+) A-I      intronic
chr2:32512158(+) A-I      intronic
chr2:32526901(+) A-I      intronic
chr2:32512235(+) A-I      intronic
chr2:32526985(+) A-I      intronic
chr2:32522655(+) A-I      intronic
chr2:32505780(+) A-I      intronic
chr2:32528252(+) A-I      intronic
chr2:32525382(+) A-I      intronic
chr2:32524939(+) A-I      intronic
chr2:32506441(+) A-I      intronic
chr2:32527241(+) A-I      intronic
chr2:32527266(+) A-I      intronic
chr2:32506500(+) A-I      intronic
chr2:32511836(+) A-I      intronic
chr2:32525067(+) A-I      intronic
chr2:32520691(+) A-I      intronic
chr2:32525150(+) A-I      intronic
chr2:32528648(+) A-I      intronic
chr2:32528607(+) A-I      intronic
chr2:32523637(+) A-I      intronic
chr2:32522311(+) A-I      intronic
chr2:32528404(+) A-I      intronic
chr2:32506860(+) A-I      intronic
chr2:32520812(+) A-I      intronic
chr2:32507558(+) A-I      intronic
chr2:32523906(+) A-I      intronic
chr2:32520894(+) A-I      intronic
chr2:32520721(+) A-I      intronic
chr2:32521495(+) A-I      intronic
chr2:32521490(+) A-I      intronic
chr2:32520852(+) A-I      intronic
chr2:32521399(+) A-I      intronic
chr2:32512128(+) A-I      intronic
chr2:32512193(+) A-I      intronic
chr2:32506811(+) A-I      intronic
chr2:32506576(+) A-I      intronic
chr2:32528206(+) A-I      intronic
chr2:32523867(+) A-I      intronic
chr2:32528267(+) A-I      intronic
chr2:32513968(+) A-I      intronic
chr2:32523694(+) A-I      intronic
chr2:32512149(+) A-I      intronic
chr2:32528503(+) A-I      intronic
chr2:32507890(+) A-I      intronic
chr2:32526904(+) A-I      intronic
chr2:32513794(+) A-I      intronic
chr2:32521331(+) A-I      intronic
chr2:32528282(+) A-I      intronic
chr2:32520877(+) A-I      intronic
chr2:32524933(+) A-I      intronic
chr2:32521339(+) A-I      intronic
chr2:32522287(+) A-I      intronic
chr2:32524080(+) A-I      intronic
chr2:32527261(+) A-I      intronic
chr2:32526892(+) A-I      intronic
chr2:32525215(+) A-I      intronic
chr2:32521447(+) A-I      intronic
chr2:32506476(+) A-I      intronic
chr2:32523863(+) A-I      intronic
chr2:32523817(+) A-I      intronic
chr2:32527297(+) A-I      intronic
chr2:32528644(+) A-I      intronic
chr2:32520869(+) A-I      intronic
chr2:32512099(+) A-I      intronic
chr2:32507268(+) A-I      intronic
chr2:32521542(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED YIPF4
chr2:32506698(+) A-I intron -    22028664
chr2:32506718(+) A-I intron -    22028664
chr2:32506732(+) A-I intron -    22028664
chr2:32506741(+) A-I intron -    22028664
chr2:32506771(+) A-I intron -    22028664
chr2:32506778(+) A-I intron -    22028664
chr2:32506779(+) A-I intron -    22028664
chr2:32506781(+) A-I intron -    22028664
chr2:32506786(+) A-I intron -    22028664
chr2:32506801(+) A-I intron -    22028664
chr2:32506808(+) A-I intron -    22028664
chr2:32506811(+) A-I intron -    22028664
chr2:32506853(+) A-I intron -    22028664
chr2:32506870(+) A-I intron -    22028664
chr2:32506876(+) A-I intron -    22028664
chr2:32506885(+) A-I intron -    22028664
chr2:32506889(+) A-I intron -    22028664
chr2:32506892(+) A-I intron -    22028664
chr2:32506896(+) A-I intron -    22028664
chr2:32506905(+) A-I intron -    22028664
chr2:32506909(+) A-I intron -    22028664
chr2:32506913(+) A-I intron -    22028664
chr2:32506914(+) A-I intron -    22028664
chr2:32506919(+) A-I intron -    22028664
chr2:32506927(+) A-I intron -    22028664
chr2:32515694(+) C-A exon CDS    21725310
chr2:32504245(+) A-G intron -    22484847
chr2:32505780(+) A-G intron -    22484847
chr2:32506410(+) A-G intron -    22484847
chr2:32506411(+) A-G intron -    22484847
chr2:32506441(+) A-G intron -    22484847
chr2:32506476(+) A-G intron -    22484847
chr2:32506576(+) A-G intron -    22484847
chr2:32506801(+) A-G intron -    22484847
chr2:32506811(+) A-G intron -    22484847
chr2:32507231(+) A-G intron -    22484847
chr2:32507268(+) A-G intron -    22484847
chr2:32507558(+) A-G intron -    22484847
chr2:32507563(+) A-G intron -    22484847
chr2:32508025(+) A-G intron -    22484847
chr2:32511732(+) A-G intron -    22484847
chr2:32511804(+) A-G intron -    22484847
chr2:32512130(+) A-G intron -    22484847
chr2:32512149(+) A-G intron -    22484847
chr2:32512154(+) A-G intron -    22484847
chr2:32512158(+) A-G intron -    22484847
chr2:32512235(+) A-G intron -    22484847
chr2:32513736(+) A-G intron -    22484847
chr2:32517743(+) A-G intron -    22484847
chr2:32517773(+) C-A intron -    22484847
chr2:32517830(+) A-G intron -    22484847
chr2:32520703(+) A-G intron -    22484847
chr2:32520721(+) A-G intron -    22484847
chr2:32520734(+) A-G intron -    22484847
chr2:32520742(+) A-G intron -    22484847
chr2:32520790(+) A-G intron -    22484847
chr2:32520812(+) A-G intron -    22484847
chr2:32520852(+) A-G intron -    22484847
chr2:32520869(+) A-G intron -    22484847
chr2:32520877(+) A-G intron -    22484847
chr2:32520892(+) A-G intron -    22484847
chr2:32520894(+) A-G intron -    22484847
chr2:32521331(+) A-G intron -    22484847
chr2:32521380(+) A-G intron -    22484847
chr2:32521399(+) A-G intron -    22484847
chr2:32521407(+) A-G intron -    22484847
chr2:32521447(+) A-G intron -    22484847
chr2:32521495(+) A-G intron -    22484847
chr2:32522257(+) A-G intron -    22484847
chr2:32522287(+) A-G intron -    22484847
chr2:32522311(+) A-G intron -    22484847
chr2:32522461(+) A-G intron -    22484847
chr2:32522582(+) A-G intron -    22484847
chr2:32523637(+) A-G intron -    22484847
chr2:32523657(+) A-G intron -    22484847
chr2:32523693(+) A-G intron -    22484847
chr2:32523694(+) A-G intron -    22484847
chr2:32523757(+) A-G intron -    22484847
chr2:32523767(+) A-G intron -    22484847
chr2:32523817(+) A-G intron -    22484847
chr2:32524047(+) A-G intron -    22484847
chr2:32524076(+) A-G intron -    22484847
chr2:32524080(+) A-G intron -    22484847
chr2:32524089(+) A-G intron -    22484847
chr2:32524113(+) A-G intron -    22484847
chr2:32524121(+) A-G intron -    22484847
chr2:32524157(+) A-G intron -    22484847
chr2:32524721(+) A-G intron -    22484847
chr2:32524933(+) A-G intron -    22484847
chr2:32525067(+) A-G intron -    22484847
chr2:32525224(+) A-G intron -    22484847
chr2:32525232(+) A-G intron -    22484847
chr2:32527180(+) A-G intron -    22484847
chr2:32527289(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase YIPF4
chr2:32503035-32503036(+) m6A 5'UTR       24981863
chr2:32503114-32503115(+) m6A 5'UTR       22575960
chr2:32532168-32532169(+) m6A 3'UTR//intron       24981863
chr2:32532190-32532191(+) m6A 3'UTR//CDS       24981863
chr2:32532195-32532196(+) m6A 3'UTR//CDS       24981863
chr2:32532268-32532269(+) m6A 3'UTR       24981863
chr2:32533789-32533790(+) m6A 3'UTR       24981863
chr2:32533803-32533804(+) m6A 3'UTR       24981863
chr2:32533808-32533809(+) m6A 3'UTR       24981863
chr2:32533813-32533814(+) m6A 3'UTR       24981863
chr2:32533821-32533822(+) m6A 3'UTR       24981863
chr2:32533826-32533827(+) m6A 3'UTR       24981863
chr2:32533911-32533912(+) m6A 3'UTR       24981863
chr2:32533922-32533923(+) m6A 3'UTR       24981863
chr2:32535508-32535509(+) m6A 3'UTR       24981863
chr2:32541108-32541109(+) m6A 3'UTR       22608085
chr2:32541162-32541163(+) m6A 3'UTR       24981863//27773535//22608085
chr2:32541172-32541173(+) m6A 3'UTR       24981863//27773535//22608085
chr2:32541209-32541210(+) m6A 3'UTR       24981863//27773535//22608085
chr2:32541238-32541239(+) m6A 3'UTR       24981863//27773535//22608085
chr2:32541248-32541249(+) m6A 3'UTR       22608085
chr2:32541255-32541256(+) m6A 3'UTR       22608085
chr2:32541274-32541275(+) m6A 3'UTR       22608085
chr2:32541315-32541316(+) m6A 3'UTR       22608085

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate hsa-miR-190a-5p
Exosome Hepatocellular carcinoma cell line (HepG2)|Lung epithelial carcinoma cell line (A549)     20615901
Exosome Brain tissue     23382797
Exosome Plasma     23663360
Exosome Plasma     24683445
Exosome Breast milk|Cell lines|Epididymal epithelial cells|Osteoblast|Plasma|Primary glioblastoma neurosphere cells|Primary keratinocyte|Saliva|Serum|Urine     -
Microvesicle Hepatocellular carcinoma cell line (HepG2)|Lung epithelial carcinoma cell line (A549)     20615901
Microvesicle Colon cancer cell line (LIM1863)|Mesenchymal stem cells|Urine     -
YIPF4
Cytosol HeLa-S3 cells     -
Endoplasmic reticulum Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Exosome Blood     -
Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hsa-miR-190a-5p
Interactor2: YIPF4

Evidence Support:


Weak-Evidence RNA-Seq
Prediction-Evidence DIANA-microT//miRDB//Targetscan
Support Database ViRBase

References:


PMID 31570108 Target region None
Source ViRBase Interactor1 expression None
Tissue or cell line ARPE-19 human RPE cells Interactor2 expression None
Description Table 1 List of miRNAs that were differentially expressed between EBOV- and mock-infected human RPE cells at 24 h post-infection.Putative target genes in EBOV-infected human RPE cells were predicted from the 15 highly differentially expressed miRNAs using algorithms: 2629 targets by Diana microT; 1799 targets by miRDB; and 14315 targets by TargetScan (Additional file 5).

Starting a new search, please wait ...